بررسي اثر قدرت يوني بر ديناميك كانال يوني پتاسيم KcsA

Investigating the effect of ionic strength on dynamics of KcsA potassium ion channel

در اين مقاله تلاش شده است كه با استفاده از محاسبات ديناميك مولكولي، اثر قدرت يوني بر ديناميك يون در كانال يوني پتاسيم KcsA بررسي شود. نتايج نشان مي دهد كه اعمال قدرت يوني تاثير مثبتي بر پايداري سيستم دارد، اما ديناميك يون هاي پتاسيم را در كانال دچار اختلال مي كند، به گونه اي كه ظاهرا اختلاف پتانسيل 100mV در دو سر كانال، براي شارش يون كافي نيست. اين رفتار به ميدان موضعي متقابل ايجاد شده در اثر يون هاي اضافي نسبت داده مي شود و لذا با افزايش اختلاف پتانسيل دو سر كانال مشاهده كرديم كه شارش يون دوباره برقرار مي شود.

In this paper, molecular dynamics simulations are used to investigate the effect of ionic strength on ion dynamics in KcsA potassium ion channel. The results show that although ionic strength enhances stability of the system, it disturbs ion dynamics in the channel in such a way that a potential difference of about 100 mV between the channel sides seems insufficient for ion flow. This behavior is attributed to the inverse local field produced by extra ions and hence increasing the potential difference re-establishes the ion flow