ديناميك ماكرومولكول ميله اي شكل خود پيش ران در حضور موانع با توزيع تصادفي به روش شبيه سازي ديناميك مولكولي

Dynamics of a rod-like self-propelled macromolecule in the presence of randomly distributed spherical obstacles using molecular dynamics simulation

در اين مقاله ديناميك يك ماكرومولكول ميله اي ش كل خود پيش ران را در حضور موانع با توزيع تصادفي به روش شبيه سازي ديناميك مولكولي بررسي مي كنيم . از آنجا كه ديناميك اين ماكرو مولكول در چهارچوب آزمايشگاه و در زمانهاي بلند فرآيند پخش عادي را دنبال مي كند، نمودار تغييرات ضريب پخش مركز جرم آن را در چهارچوب آز مايشگاه بر حسب چگالي موانع محيط بدست مي آوريم . در اين نمودار با افزايش تعداد موانع كروي درون سيال، مقدار ضريب پخش ماكرومولكول خود پيش ران ابتدا افزايش مي يابد و در كسر حجمي هاي بزرگتر از ϕobs=0.45 دوباره كاهش مي يابد . در چهارچوب جسم و زمانه اي بلند كه ديناميك ماكرومولكول از الكوريتم گشت تصادفي جهت دار پيروي مي كند نمودار مقدارسرعت رانشي ماكرومولكول م يله اي خود پيش ران را در راستاي موازي با محور ميله در چهارچوب جسم بر حسب كسر حجمي موانع بدست مي آوريم.

In this paper, dynamics of a rod-like self-propelled macromolecule in the presence of randomly distributed obstacles is studied using molecular dynamics simulations. It has been observed that diffusion coefficient of the macromolecule increases with increasing the number of spherical obstacles in the solution up to ϕobs= 0.45 . Diffusion coefficient decreases as a function of the obstacles density greater than ϕobs= 0.45 in the lab frame. In the body frame the value of drift velocity decreases with increasing the number of spherical obstacles monotonically