مقايسه برهمكنش اسيد آمينه سرين با نانولوله كربني و گرافن

Comparison of the Serine amino acid interaction with carbon nanotube and graphene

در اين پژوهش جذب اسيد آمينه قطبي سرين توسط نانولوله كربني و صفحه گرافن توسط روش شبيه‌سازي ديناميك مولكولي استاندارد مورد بررسي قرار گرفته است. شبيه‌سازي برهمكنش خودجوش سرين و نانولوله كربني حل شده در مولكول‌هاي آب به مدت ns40 انجام شده و نتايج حاصل با شبيه‌سازي ديناميك مولكولي جذب خودجوش سرين توسط صفحه گرافن به مدت ns40 مورد مقايسه قرار گرفته است. نتايج نشان مي‌دهد اگرچه به علت قطبي بودن اسيد آمينه برهمكنش سرين با نانولوله كربني ضعيف است ولي قدرت جذب صفحه گرافن براي سرين به مراتب قويتر است. اين اطلاعات مي‌تواند كمك شايان توجهي به ساخت حسگرهاي زيستي بر پايه نانولوله‌هاي كربني و صفحات گرافن بكند.

In this research, the adsorption of Serine (SER) amino acid on the carbon nanotube (CNT) and the graphene sheet is investigated using standard molecular dynamics (MD) simulation. The MD simulation of the spontaneous interaction of SER and CNT solvated in a water box is performed over 40ns and the results is compared with the MD simulation of spontaneous adsorption of SER on the grapahene sheet over 40 ns. The results show that although due to the polar nature of the amino acid, the interaction of the SER with CNT is weak, but the SER affinity for the graphene sheet is strong. These simulations might provide important information about the biosensor development based on the CNTs and the graphene nanosheets.