تعيين اپي توپ هاي فضايي زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان توسط ايمونوانفورماتيك

ايمونوگلوبولين ها كه از زنجيره هاي سبك و سنگين تشكيل شده اند، گروهي از پروتئين هاي سرم هستند كه نقش مهمي در دفاع عليه ميكروارگانيسم ها بر عهده دارند. زنجيره هاي سبك بر اساس تفاوت در انتهاي كربوكسيلي ناحيه ثابت خود به دو ايزوتيپ كاپا (κ) و لامبدا (λ) تقسيم مي شوند. تغييرات قابل توجهي در نسبت زنجيره هاي كاپا به لامبدا، در بدخيمي سلول-هاي B يا در عفونت با ويروس ايدز در دوران جنيني، ممكن است روي دهد. جهت سنجش دقيق يا هدف گيري اختصاصي زنجيره هاي سبك براي اهداف درماني، ابزارهايي شناسايي اختصاصي داراي حساسيت و ويژگي بالا از جمله آنتي بادي هاي منوكلونال مورد نياز هستند و بدين منظور تعيين دقيق اپي توپ هاي اختصاصي زنجيره هاي سبك حائز اهميت خاصي است. ايمونوانفورماتيك شاخه اي از علم ايمونولوژي است كه با به كارگيري اطلاعات زيستي موجود در كامپيوتر به تشخيص دقيق تر بيماري ها كمك مي كند. هدف مطالعه حاضر بررسي و تعيين اپي توپ هاي فضايي زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان توسط ايمونوانفورماتيك مي باشد. توالي اسيدهاي آمينه و ساختار سوم زنجيره سبك ايمونوگلوبولين مرجع انسان در پايگاه اطلاعاتي PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم زنجيره سبك توسط نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogy Recognition Engine V 2.0) و اپي توپ هاي فضايي زنجيره سبك توسط نرم افزار CEP تعيين شدند. در اين مطالعه 5 اپي توپ فضايي در دومين ثابت زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان توسط نرم افزار CEP شناسايي شد. اپي توپ هاي فوق الذكر در ناحيه قرارگيري اسيدهاي آمينه شماره 100 الي 214 واقع شده اند. در اين پژوهش تعدادي از اپي-توپ هاي فضايي دومين ثابت زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان شناسايي شدند. اين اپي توپ ها ابزارهاي بسيار ارزشمندي جهت توليد آنتي بادي هاي مونوكلونال شناسايي كننده اختصاصي زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان بوده و مي توانند به طور بالقوه براي توليد كيت هاي تشخيص اختصاصي زنجيره سبك ايمونوگلوبولين، درمان برخي از بدخيمي هاي لنفوسيت B، تعيين نقشه اپي توپ هاي زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان و مطالعات تكاملي مفيد باشند.