ارزيابي بيوانفورماتيكي has-miR-187-3p مرتبط با پلي مورفيسم تك نوكلئوتيدي rs7524556 ژن RASAL2 و ابتلا به سرطان مثانه

سرطان مثانه چهارمين سرطان رايج در ميان مردان و سيزدهمين سرطان رايج زنان است. آنژيوژنز سرطاني يك فرآيند ضروري براي پيشرفت و متاستاز سرطان مثانه است. يافته هاي جديد نشان مي دهند كه پروتئين كد شده توسط ژن RASAL2 مي تواند از آنژيوژنز در سرطان مثانه جلوگيري كند. كاهش بيان ژن RASAL2 باعث افزايش فسفريله شدن AKT و درنتيجه افزايش بيان ژن هاي ETS1 و VEGFA مي شود. ژن RASAL2 بر روي كروموزوم 1 در جايگاه 1q25.2 قرار دارد. پلي-مورفيسم هاي تك نوكلئوتيدي از گروه ماركرهاي ژنتيكي مرتبط با بسياري از بيماري هاي ژنتيكي مي باشند. microRNA ها به عنوان بيوماركر با تنظيم و كنترل بيان ژن ها در سطح mRNA اثر خود را اعمال مي كنند. هدف اين پژوهش ارزيابي بيوانفورماتيكي has-miR-187-3p مرتبط با پلي مورفيسم تك نوكلئوتيدي (rs7524556) ژن RASAL2 با نقش بازدارنده ي سرطان مثانه بوده است. به اين منظور پايگاه هاي داده ي NCBI ، miRNASNP، miRBase، miRWalk2.0 و DAVID مورد استفاده قرار گرفتند. بررسي ها در رابطه با rs7524556 مشخص ساخت كه در جايگاه اين SNP آلل C به T و G تبديل مي-شود، كه ممكن است بر اتصال و عملكرد microRNA هاي مربوط به اين ناحيه اثر گذار باشد. بررسي هاي انجام شده بر روي has-miR-187 نشان داد كه اين microRNA با قدرت بالايي به 3ˊUTR رونوشت ژن RASAL2 متصل مي شود و عمل مهاري خود را اعمال مي كند. با توجه به نقش has-miR-187-3p در سرطان مثانه، به دست آوردن ژن هاي هدف آن از طريق پايگاه داده miRWalk2.0 و ارزيابي مسيرهاي سيگنالي مرتبط با استفاده از پايگاه داده DAVID ، اين microRNA به منظور آناليزهاي بعدي انتخاب گرديد. بر اين اساس آلل C كه آلل غالب در جمعيت است، در جايگاه SNP مورد نظر مي-تواند با بروز سرطان مثانه در ارتباط باشد.