شماره ركورد كنفرانس :
4885
عنوان مقاله :
كاربرد RAPD-PCR در تايپينگ جدايه هاي سودوموناس آئروژينوزا جداسازي شده از نمونه هاي باليني
پديدآورندگان :
خواجه سعيدي زهرا saeedi.zahra93@gmail.com گروه زيست شناسي، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامي، بروجرد، ايران , ميرزايي محسن mirzaei@gmail.com گروه علوم آزمايشگاهي، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامي، بروجرد، ايران , ياري رضا yari@gmail.com گروه زيست شناسي، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامي، بروجرد، ايران
كليدواژه :
سودوموناس آئروژينوزا , مقاومت آنتي بيوتيكي , RAPD-PCR.
عنوان كنفرانس :
سومين همايش ملي علوم زيستي دانشگاه آزاد اسلامي واحد دامغان
چكيده فارسي :
سودوموناس آئروژينوزا يكي از پاتوژن هاي فرصت طلب بيمارستاني مي باشد. با توجه به مقاومت بالاي اين باكتري نسبت به عوامل ضدباكتريايي اهميت مقاومت آن را دوبرابر كرده است. همچنين بررسي الگو ي ژنتيكي اين ايزوله ها ناشي از اين باكتري ضروري است. هدف از اين مطالعه بررسي و ارزيابي ارتباط بين سويه هاي مختلف، ميزان تنوع ژنتيكي ايزوله هاي سودوموناس آئروژينوزا و مقاومت آنتي بيوتيكي با استفاده از روش ژنوتايپينگ RAPD-PCRمي باشد. با هدف بررسي تنوع ژنتيكي و مقاومت آنتي بيوتيكي، 103 ايزوله سودوموناس آئروژينوزا از نمونه هاي باليني بيمارستان شهيد بهشتي قم جمع-آوري گرديد. طبق استاندارد CLSIالگوي آنتي بيوگرام نسبت به 12 آنتي بيوتيك به روش ديفيوژن مورد بررسي قرار گرفت. بررسي تنوع ژنتيكي با استفاده از10 پرايمر كوتاه شركت اُپرون و الگوي الكتروفورزي تكرارپذير با روش RAPD-PCR انجام شد. تنوع ژنتيكي و ميزان پلي مورفيسم بين سويه ها با نرم افزار NTSYS و MVSP مورد ارزيابي قرار گرفت. 38 نمونه از عفونت هاي ادراري، 37 نمونه از سوختگي ها، نمونه از خلط خوني و 8 نمونه از خون بيماران بودند. بالاترين ميزان مقاومت آنتي بيوتيكي در بين سويه ها مربوط به سفوتاكسيم با 72/75 درصد و كمترين مقاومت مربوط به سفتازيديم + كلاونيك 59/13 درصد بود. در الگوي PCR، طول باندها از bp100 تا Kb3 متغير بود. مجموع كل باند ها 620 مي باشد و ميانگين پلي مرفيسم ايزوله ها 2/51 درصد بود. بيشترين تعداد باندهاي پلي مورف توسط پرايمر OPX-01 با 16 باند ايجاد گرديد. اين روش بخوبي توانست با ترسيم دندروگرام UPGMA و NJ ايزوله ها را با توجه به منشا اخذ نمونه ها از يكديگر تفكيك كند. نتايج نشان دهنده تنوع ژنتيكي بسيار بالايي بين نمونه ها بود، اين امر حاكي از تنوع منابع آلودگي در نمونه هاي باليني در شهرستان قم مي باشد. با توجه به قدرت افتراق بالا و الگوي الكتروفورزي تكرار پذير در مطالعات اپيدميولوژيك تكنيك RAPD-PCR يكي از روش هاي دقيق و درست براي ارزيابي ارتباط ژنتيكي بين سويه هاي سودوموناس آئروژينوزا مي باشد. اين تكنيك اطلاعاتي در مورد تنوع ژنتيكي خانواده ها و زيرخانواده و شناخت كامل از ميزان تشابه آن ها و همچنين اطلاعاتي در مورد ميزان مقاومت آن ها به آنتي بيوتيك ها با توجه به الگوي ژنتيكي حاصله در PCR به ما مي دهد.