بررسي بيوانفورماتيكي خصوصيات بيوشيميايي برخي ايزوفرم هاي آنزيم آسكوربات پراكسيداز

تنشهاي غير زيستي شكلگيري تركيبات راديكالهاي آزاد اكسيژن را در بافتهاي گياهي تحريك مي كند . اين تركيبات آسيب زيادي به سيستم فتوسنتز در گياه وارد مي نمايند . گياهان براي رشد طبيعي خود و مقابله با اثرات مخرب اين تركيبات از سيستم سمزدايي توسط آنتيا كسيدانتها استفاده مي كنند . در ميان مكانيسمهاي آنتيا كسيدانت ، سمزاديي آنزيم آسكورباتپراكسيداز نقشي مهم در حفاظت از گياه در برابر آسيبهاي اكسيداتيو ايفا مي كند . ايزوفرمهاي مختلف سيتوسولي ، كلروپلاستي (استرومايي يا تيلاكوتيدي ) پراكسي زومي و ميتوكندريايي اين آنزيم كه نقش عمده ي سمزدايي ROS را در اجزاي مختلف سلولي بر عهده دارند و از نظر PHاپتيمم ، پايداري ،اتصال اختصاصي به غشا و ميزان پاسخ به تنش باهم تفاوت دراند . برخياز خصوصيات فيزيكوشيميايي ايزوفرمهاي مختلف اين آنزيم در گياهان مختلف بررسي شد . ابتدا تواليهاي ايزوفرمهاي مختلف آنزيم از پايگاه Uniprot جمع آوري شد و با نرم افزار Clustalw مقايسه شدند . آناليزهاي بعدي و محاسبه ي برخي از خصوصيات فيزيكوشيميايي پروتئين با نرم افزار Protparam نشان داد با وجود اينكه در ايزوفرمهاي مختلف اين آنزيم اسيد آمينه هاي شركت كننده در جايگاه فعال و يا واكنش الكتروستاتيك با سوبسترا در تمام گياهان بسيار محافظت شده مي باشد اما اين آنزيم ها در ويژگي هايي مانند ضريب پايداري ، مقاومت در برابر حرارت و pI متافوت مي باشند و برخي از ايزوفرمها به دليل حضورشان در اندامكهايي كه ميزان توليد ROS بيشتر است پايدارتر و نيمه ي عمر بالاتري دارند .