بررسي پروتئوم غشاء پلاسمايي آرابيدوپسيس با روش 2D-LC-MALDI-TOF-MS/MS

غشاء پلاسماي بعنوان رابطي بين عوامل محيطي و داخل سلول نقش ساختاري و عملكردي در تبادل اطلاعات و مواد دارد. انتقال سيگنالهاي درگير در پاسخ به عوامل تنشزا (زيستي و غيرزيستي) در غشاي پلاسمايي رخ ميدهد. پروتئوميكس غشاء گياهي ميتواند اطلاعات ارزشمندي در مورد فرآيندهاي گياهي را فراهم آورد. در اين تحقيق با استفاده از روش 2DLC و طيف سنجي جرمي به روش MALDI-TOF-MS/MS با برنامه Mascot با استفاده از منابع پايگاه TAIR8 بيش از 1200 پروتئين غشائي برگ گياه آرابيدوپسيس شناسايي گرديد. بيش از 900 پروتئين با ضريب اطمينان 99% و بيش از دو پپتيد مشخص گرديد. جهت تعيين عملكرد و دومين پروتئينها از پايگاههاي PPDB و TAIR استفاده گرديد و باتوجه به اطلاعات بدست آمده و براساس نوع عملكرد، پروتئينها در شش گروه : حاملها، پيام رسانها، پروتئينهاي تنش، وزيكولها و پروتئينهاي ديواره سلولي تقسيمبندي شدند كه قسمت اعظم پروتئينها داراي عملكرد ناشناخته بودند و در كل 69 پروتئين شناخته شده جزء گروه گيرنده هاي شبه كينازي بودند. در مقايسه با ساير روشها، روش بكار رفته در اين تحقيق تعداد بيشتري از پروتيين هاي پيش بيني شده در غشاي پلاسمايي را در سطح پروتئين شناسايي كرد.