بررسي miRNA ها و شناسايي ژن هاي هدف آنها در گياه برنج و آناليز مقايسه هاي آنها با آرابيدوپسيس، ذرت و انگور

اMicroRNA ( miRNA) ها يكي از انواع RNA هاي كوچك درون زاد غيركد كننده پروتئين مي باشند كه در تنظيم فرايندهاي گوناگون سلولي نقش دارند. همچنين تحقيقات نشان داده كه miRNA ها نقش مهمي در پاسخ به تنش هاي محيطي ايفا مي كنند. شناسايي miRNA ها در گونه هاي مختلف در سال هاي اخير بسيار مورد توجه قرار گرفته است. در اين تحقيق miRNA هاي گياه برنج؛ به منظور بررسي خصوصيات ساختار ساقه- حلقه، توالي و ژن هاي هدف آنها با استفاده از روش هاي بيوانفورماتيكي مورد بررسي قرار گرفتند. همچنين مقايسه هاي بين miRNA هاي برنج با آرابيدوپسيس، ذرت و انگور به منظور شناسايي miRNA هاي حفاظت شده و ژن هاي هدف آنها انجام شد. نتايج نشان داد كه با وجود ساختار ثانويه مشابه، توالي ناحيه ساختار ساقه- حلقه بسيار متنوع بود، با اين وجود توالي miRNA بالغ در ميان گونه هاي مختلف مورد بررسي بسيار شبيه بود. همچنين فراوان ترين نوكلئوتيد در انتهاي 5 مولكول miRNA با طول 20، 21 و 22 اوراسيل و براي طول 24 آدنين بود. miRNA هاي حفاظت شده در ميان چهار گونه مورد بررسي و همچنين يك miRNA هاي اختصاصي برنج و يك miRNA هاي اختصاصي تك لپه ها شناسايي شد. ژن هاي هدف براي تمامي miRNA ها شناسايي شدند كه عمده ترين آنها فاكتورهاي رونويسي بودند.