توالي يابي ناحيه رمزكننده و تجزيه وتحليل توالي هاي نوكلئوتيدي، پروتئيني و راه اندازژن مقاومت به زنگ نواري yr5،در سه رقم گندم

زنگ زرد يكي از مهم ترين بيماري هاي گندم در ايران و جهان مي باشد. سال هاي اخير پيشرفت هاي عظيمي در زمينه افزودن اطلاعات توالي درون بانك هاي ژن و داده هاي بيان در پايگاه هاي داده اي ژنوميكي متفاوت، حاصل شده است. Tr5 از ژن هاي مقاومت به زنگ زرد در مرحله گياهچه اي است كه در مقابل تمام نژادهاي بيمارگر گندم موثر بوده و پيوستگي شديدي با چند ژن مهم ديگر مقاومت به اين بيماري دارد. جهت بررسي توالي اين ژن با كمك نشانگر YrSTS(7,8) واكنش PCR انجام و پس از تخليص نمونه ها، محصولات توالي يابي شدند. تجزيه و تحليل بيو انفورماتيكي توالي نوكلئوتيدي و پروتئيني از طريق NCBI و نرم افزارهاي VectorNTI و CLCbio Sequence viewer6 انجام پذيرفت. توالي راه انداز در پايگاه هاي PHYTOZOME و PLANTCARE بررسي گرديد. تجزيه و تحليل نشان دهنده ي همساني ترادف نوكلئوتيدي در هر سه ژنوتيپ است. بررسي توالي پروتئيني حاكي از مشابهت اسيد آمينه ها در توالي ژنوتيپ هاي بولاني، Triticum speltavar. album، و پيشتاز و توالي نشانگر Xwgp17 و تفاوت توالي پروتئيني رقم Avocet’S’ با ساير توالي ها مي باشد. جانشيني و تغيير در اسيد آمينه هاي قطبي و غير قطبي مي تواند دليلي برحساسيت رقم Avocet’S’ در برابر بيماري زنگ زرد باشد. وجود دامنه NB-ARC كه در پاسخ به بيماري هاي گياهي موثر است. در كليه توالي ها مشخص گرديد. راه انداز نيز داراي موتيف هايي مرتبط با واكنش به تنش هاي زيستي مي باشد.