بررسي بيوانفورماتيكي عملكرد ژن شبه دفنسين D2 در گياه توت فرنگي

موجودات زنده شامل گياهان معمولا در معرض پاتوژن هاي بيشماري در طبيعت قرار دارند.آنها در پاسخ به حمله پاتوژن ها يك سيستم ايمني ذاتي تكاملي توسعه داده اند.دفنسين هاي گياهي پپتيدهاي كوچك،بسيار پايدار و غني از سيستئين هستند كه بخشي از سيستم ايمني ذاتي،كه عمدتا در برابر پاتوژن هاي قارچي شديدا مقاوم هستند هدف از اين تحقيق مقايسه پروموتر ژن دفنسين در گياهان مختلف است تا امكان معرفي آن به عنوان پروموتري القاپذير اختصاصي در مقابل بيمارگرها مورد بررسي قرار گيرد.بدين منظور با استفاده از بانك بيوانفورماتيكي فيتوزوم(PHYTOZOME)؛1500 نوكلئوتيد بالادست ناحيه كد كننده ژن دفنسين توت فرنگي به عنوان پروموتر انتخاب شد.سپس توسط نرم افزار PLANTCARE مورد بررسي قرار گرفت .نتايج نشان داد كه پروموتر ژن دفنسين در اين گياهان داراي عناصر اختصاصي پاسخ به هورمون هاي ساليسيلك اسيد ،جاسمونيك اسيد و ديگر عناصر پاسخ به زخم،خشكي،قارزچ،جيبرلين و اكسين است.با حضور پروموترهاي القا پذير ،ژن هاي پاسخ دهنده بيمارگر در زمان حمله بيمارگر پاسخ داده و بار متابوليكي اضافي در زمان غياب تحميل نخواهد شد.از طرفي با كاهش مصرف سموم شيميايي بسياري از هزينه هاي سم پاشي . آثار مخرب زيست محيطي اين سموم كاهش خواهد يافت.