بررسي ارتباط ويژگي هاي فيزيولوژيكي و تكاملي ژن هاي متابوليكي با مكان آنها در گراف سلسه مراتبي همراهي شارها

مفهوم همراهي شارها يكي از مفاهيمي است كه براي بررسي ارتباط رفتاري واكنش ها در شبكه هاي متابوليكي استفاده مي شود. تاكنون مطالعات زيادي به بررسي ارتباط بين ويژگي هاي مختلف واكنش هاي شبكه هاي متابوليكي پرداخته اند. يكي از ويژگي هايي كه به آن توجه زيادي شده روابط همراهي شار بين واكنش ها است. در اين مقاله، گراف همراهي شار براي واكنش هاي شبكه متابوليكي باكتري اي كولاي ساخته شد. سپس عمق هر واكنش در اين گراف تعيين شد و ترتيب واكنش ها در متابوليسم، ميزان ضروري بودن واكنش ها، قدمت واكنش ها از لحاظ تكاملي و مكان ژن ها در گراف تنظيم بيان ژن مورد بررسي قرار گرفت. نتايج نشان مي دهد كه به طور كلي واكنش هايي كه در گراف در سطوح بالاتر قرار دارند نسبت به واكنش هاي سطوح پايين تر، براي بقاي سلول ضروري تر بوده ونقش بيشتري را در وقايع تنظيمي ايفا مي كنند. همچنين به جز واكنش هاي تبادلي كه درصد زيادي از واكنش هاي اين سطوح را تشكيل مي دهند و از نظر تكاملي جديدتر هستند عمده ي واكنش هاي اين سطوح واكنش هاي حفظ شده مي باشند. اهميت زياد واكنش هاي سطوح بالاتر براي بقاي سلول و در وقايع تنظيمي آن نشان دهنده ي اين است كه اين واكنش ها مي توانند هدف هاي مناسبي براي دستكاري هاي ژنتيكي در مطالعات بيوتكنولوژي باشند.