شماره ركورد كنفرانس :
4522
عنوان مقاله :
بررسي نقش موتيف N-terminal cxxc در پمپ انتقال دهنده فلزات سنگين در گياهان فرا انباشتگر فلزات سنگين و غير فراانباشتگر با استفاده از بيوانفورماتيك
پديدآورندگان :
اشرفي دهكردي الهام دانشگاه شيراز , عالم زاده عباس دانشگاه شيراز , ابراهيمي اسماعيل دانشگاه شيراز
كليدواژه :
بيوانفورماتيك , پمپ P1B-ATPase , موتيف CXXC
عنوان كنفرانس :
هشتمين همايش بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران و چهارمين همايش ملي امنيت زيستي
چكيده فارسي :
چذب و تجمع فلزات سنگين در گياهان فراانباشتگر و غير فراانباشتگر متفاوت است كه اين تفاوت به ساختار پروتئين هاي موثر در اين فرايندها برمي گردد. به همين منظور براي بررسي ساختار پروتئيني پمپ انتقال دهنده فلزات سنگين در اين دو گروه از گياهان 111 توالي اين پمپ در گياهان فرا انباشتگر و غير فرا انباشتگر از بانك اطلاعاتي ExPASY گرفته شد و با استفاده از برنامه هاي بيوانفورماتيكي مورد بررسي قرار گرفت. تعداد موتيف CXXC، فاصله بين موتيف ها، تنوع اسيد آمينه اي بعد وقبل از اين موتيف ها و ساير خصوصيات پروتئيني اين پمپ ها بررسي شد. نتايج نشان دادند كه هيچ ارتباطي بين ميزان انباشتگري فلزات سنگين و اسيد آمينه قبل از موتيف CXXC و ميزان نزديكي بين اين موتيف و غشا وجود ندارد. در مقابل مشخص شد كه بيشترين اثر روي ميزان انباشتگري فلزات سنگين مربوط به تعداد موتيف CXXC در پمپ انتقال دهنده فلزات سنگين مي باشد كه در بسياري از پژوهش هاي پيشين نيز به نقش تنظيمي اين موتيف اشاره شده بود. نتايج نشان دادند كه تعداد اين موتيف در گياهان حساس كمتر است در حالي كه تعداد بيش از 3موتيف تنها در گياهان گروه فراانباشتگر و متحمل مشاهده شد. همچنين مشخص شد كه فاصله بين موتيف هاي CXXC در بين گروه هاي مختلف گياهان مورد مطالعه متفاوت است.