كلون و بررسي ساختار و جايگاه پروتئين ژن Vp28 در بيماري لكه سفيد ميگو

بروزبيماري لكه سفيد يكي از مهم ترين حادثه ها در پرورش ميگو مي باشد كه موجب كاهش توليد ميگو و خسارت اقتصادي شديدي در كل دنيا گرديده است. ترجمه ژن هاي پروتئين هاي ويروسي، شامل Vp 28 ، Vp 26 ، Vp 24 ، Vp 19 و Vp 15 در هنگام ايجاد بيماري از اين ژن ها ظاهر مي شوند، Vp 28 كه مهم ترين پروتئين پوشش ويروس مي باشند يك نقش كليدي در عفونت سيستمي بيماري لكه سفيد در ميگو دارد. در اين تحقيق نمونه ها از مزارع آلوده از شهر آبادان تهيه و به موسسه تحقيقات واكسن وسرم سازي رازي شعبه منطقه مركزي كشور(اراك) انتقال داده شد. DNA نمونه ها استخراج شده و با استفاده ازپرايمرهاي طراحي شده براي ژن Vp 28 ،PCR شدند و نمونه هايي كه آلوده به اين ويروس بودند شناسايي شدند و ژن Vp28 شناسايي شده از نمونه هاي آلوده در TA وكتور كلون شد. توالي كلون شده، توالي يابي شدو ساختار اين توالي مورد بررسي بيوانفورماتيكي قرار گرفت. ترجمه قطعه توالي يابي شده به پروتئين نشان داد كه پروتئين شامل 204 آمينو اسيد اين ژن داراي 13 رشته امتداد يافته، 2مارپيچ آلفا و 7 پيچ مي باشد و همچنين قسمت هاي قرار گيري اين پروتئين در داخل سلول، خارج سلول و قسمت هاي قرار گرفته اين پروتئين درغشاي پلاسمايي مشخص شد.