بررسي ساختار و جايگاه پروتئين ژن Vpx در بيماري گامبو رو

طي سال هاي اخير سويه هاي بسيار بيماري زايي ازويروس گامبورو باعث تلفات شديد و زيادي درجوجه ها و به خطر افتادن وايجاد نگراني و خسارت اقتصادي در صنعت ماكيان درجهان شده است، ويروس داراي دو قطعه است كه قطعه A يك پلي پروتئين 109kd را كد مي كند كه ارائه كننده سه پپتيد VPX,VP3,VP4 است كه VPX توليد يك پلي پپتيد شناخته شده به نام VP2 را مي كند كه همراه با VP3 تشكيل كپسيد ويروس را مي دهند. در ميان اين پروتئين ها، VP2 حاوي مكان هاي آنتي ژني مهمي است كه باعث ايمني به واسطه توليد آنتي بادي هاي خنثي كننده مي شوند. در اين تحقيق نمونه هاي از مرغ دارهاي شهرستان اراك تهيه و به موسسه تحقيقات واكسن و سرم سازي رازي شعبه منطقه مركزي كشور(اراك) انتقال داده شد. RNA نمونه ها استخراج شده و با استفاده از پرايمر هاي طراحي شده براي ژن VPx ، PCR شدندو نمونه هايي كه آلوده به اين ويروس بودند شناسايي شدند و ژن VPx شناسايي شده از نمونه هاي آلوده در TA وكتور كلون شد.توالي كلون شده، توالي يابي شد وساختار اين توالي مورد بررسي بيوانفورماتيكي قرار گرفت. در اين تحقيق بعد از ترجمه قظعه توالي يابي شده به پروتئين با استفاده از نرم افزار توالي 516 آمينو اسيداي اين پروتئين مورد بررسي ساختاري قرار گرفت و مشخص شد ساختار ثانويه اين توالي داراي 22 رشته امتداد يافته 4 مارپيچ آلفا و همچنين 13 پيچ مي باشد و نيز قسمت هاي درون غشايي اين پروتئين مشخص شد.