مقايسه بيوانفورماتيكي ويژگي هاي ايزوفرم هاي مختلف ژن DREB در گياهان مختلف

به منظور بررسي رايانه اي توالي اسيدآمينه ايزوفرم هاي مختلف ژن DREB و مقايسه آن ها در بين گياهان مختلف، توالي هاي اسيدآمينه اي هريك از ژن ها از سايت www.uniprot.org جمع آوري شد. سپس با استفاده از نرم افزارهاي بيوانفورماتيكي تفاوت ها و شباهت هاي موجود بين توالي ها مشخص شد. از ميان 34 ويژگي مورد بررسي مشاهده شد كه پروتئين هاي دو ايزوفرم DREB2 و DREB1 درگياهان مختلف در 10 ويژگي باهم اختلاف دارند. نتايج نشان داد كه گلوتامين و ليزين، سيستئين و سرين كه جزء اسيدآمينه هاي آبدوست هستنددر توالي اسيد آمينه اي DREB2 بيشتر و همچنين لوسين كه اسيدآمينه اي آبگريز و آليفاتيك هست در DREB1 بيشتر است. شاخص آليفاتيك كه به عنوان يك عامل مهم به منظور برآوردمقاومت پروتئين ها در برابر حرارت مي باشد در توالي هاي DREB1 بيشتر بود كه دليل آن فراواني بيشتر اسيد آمينه هاي آلانين، ايزولوسين، لوسين و والين كه همگي جزء اسيدآمينه هاي آليفاتيك مي باشند و در DREB1 بيشتر است. همچنين بالا بودن ميانگين شاخص پايداري پروتئيني مربوط به ژن DREB1 نشان دهنده ي پايداري بيشتر آن است. بررسي توالي ها نشان داد كه تفاوت معني داري بين شاخص هاي مانند طول ، وزن، بارمثبت و منفي و نقطه ايزوالكتريك وجودندارد.