بررسي مقايسه اي ويژگي هاي ساختاري چهار ژن (CDPK32 ، CPK28 ، CPK9 و CPK6) رمز كننده پروتئين كينازهاي وابسته به كلسيم در دو گياه شلغم روغني (Brassica rapa) و آرابيدوپسيس (Arabidopsis thaliana)

ژنوم شلغم روغني (Brassica rapa)به عنوان يك گونه ديپلوئيد از جنس براسيكا و دهنده ژنوم A به گونه زراعي كلزا، به طور كامل توالي يابي شده است. قرابت ژنومي اين گونه و آرابيدوپسيس امكان مقايسه و بررسي تغييرات ژن هاي ارتولوگ را فراهم مي كند. در گياهان پروتئيني كينازهاي وابسته به كلسيم درتنظيم بسياري از فعاليت هاي بيوشيميايي شركت دارند. بسياري از اعضاي اين خانواده پروتئيني درارتباط با يكديگر و در مسيرهاي بيوشيميايي مشترك فعاليت مي كنند. اين پژوهش با هدف بررسي مقايسه اي ساختار نواحي رمز شونده و پروموترهاي چهار ژن رمز كننده پروتئين كينازهاي وابسته به كلسيم درگونه هاي B. rapa و آرابيدوپسيس انجام شد. با توجه به نقش ژن CDPK32 در تنظيم پاسخ به تنش هاي غيرزنده، ژن هاي داراي پروتئين هاي مرتبط با پروتئين اين ژن با استفاده از سرويس بيوانفورماتيكي STRING شناسايي و از ميان آنها سه ژن AtCPK28 ، AtCPK9 و AtCPK6 انتخاب شدند. سپس ارتولوگ چهار ژن مورد مطالعه درژنوم B. rapa شناسايي شدند. شباهت زيادي بين ژن هاي ارتولوگ در دو گونه مورد بررسي وجود داشت اگرچه در برخي موارد تفاوت هايي از لحاظ تعداد واندازه اگزون ها مشاهده شد. بيشترين شباهت بين ژن هاي AtCPK6 و BrCPK6 بود. بررسي پروموتر ژن هاي ارتولوگ تفاوت هايي را درنوع و تعداد برخي از عناصر تنظيم كننده سپس آشكار كرد كه ممكن است الگوي بيان آنها را تحت تاثير قرار دهد.