بررسي خصوصيات يك پروتئين ناشناخته در گياه برنج با استفاده از ابزارهاي بيوآنفورماتيكي

بيوآنفورماتيك و روش هاي محاسباتي ابزاري موثر در مطالعه پروتئين مي باشند. دراين مطالعه يك توالي پروتئيني ناشناخته ثبت شده به شماره دسترسي BAD81308.1 براي بررسي و مطالعه ساختار و عملكرد احتمالي مورد استفاده قرار گرفت. پس از BLAST توالي مورد نظر برعليه ديتابيس پروتئين غيرتكراري و مقايسه تعدادي از توالي هاي استخراج شده داراي همولوژي بالابا اين پروتئين، تعدادي از دامينها و موتيف هاي مهم موجود در اين پروتئين شناسايي شدند. پروتئين مورد مطالعه به طور اختصاصي باگروهي از پروتئين هاي باند شونده به DNA تحت عنوان RPA1-DBD-Like همولوژي نشان داد. نتيجه اين همولوژي شناسايي دو دمين A و B ازاين پروتئين برروي توالي مذكور بود.