بازسازي و تجزيه و تحليل شبكه ژني تحمل به خشكي در برنج( Oryza sativa L. )

برنج يكي از ارزشمندترين محصولات از لحاظ اقتصادي و اجتماعي است. خشكي نيز مهم ترين تنش و محدوديت براي كاهش پتانسيل عملكرد اين گياه مي باشد. نظر به پيچيدگي و چند ژني بودن تحمل به خشكي دراين تحقيق سعي شده است تا با گرد آوري تمامي ژن هاي شناخته شده دخيل در تحمل به خشكي در برنج، شبكه ژني درگير بازسازي شده و تصوير روشن تري از نحوه پاسخ دهي گياه برنج به تنش خشكي و ژن هاي كليدي مربوطه حاصل شود. در مجموع 133ژن شناسايي شد و شبكه برهم كنش پروتئيني براي آن ها رسم گرديد. با استفاده از 12 الگوريتم محاسباتي Cytohubbaدر نرم افزار Cytoscape تمامي گره ها (Node) با بيشترين ارتباط (Edge) به دست آمد. اين امر منجر به شناسايي 58 گره (ژن) غير تكراري شد كه به عنوان موثرترين ژن ها در اين بين در نظر گرفته شده و شبكه ژني مربوطه رسم شد. نتايج نشان داد كه عوامل رونويسي بيشترين تعداد را در بين 58 ژن موثر داشتند. اين امر نشان دهنده اهميت اين ژن ها درمكانيسم تحمل به خشكي مي باشد. اميد است نتايج به دست آمده در راستاي يافتن راهكارهايي هدفمند جهت افزايش تحمل به خشكي مفيد واقع گردد.