مطالعه فيلوژنتيك باكتري عامل لكه زاويه اي توسكاي ييلاقي از طريق بررسي ژن dnaK

يكي از گونه هاي مهم در توليد چوب گونه توسكاي ييلاقي (Alnus subcordata) است. اين گونه با داشتن قدرت تثبيت كنندگي ازت خاك و با بيومس توليدي زياد به منظور رزاعت چوب و همچنين جنگل كاري براي احياي مناطق مخروبه جنگل هاي شمال كشور بسيار مناسب است. در چند سال اخير بيماري لكه برگي ناشي از گونه اي زانتوموناس در توسكا ييلاقي در جنگل هاي استان مازندران گزارش شده است كه گونه آن هنوز به طور دقيق شناسايي نشده است. لذا هدف اجراي تحقيق حاضر تعيين موقعيت تاكسو نوميكي باكتري زانتوموناس عامل لكه زاويه اي توسكاي كشور با استفاده از بررسي توالي ژن dnaK به عنوان يكي از ژن هاي خانه دار و حفاظت شده بود. در اين راستا تعداد 14 جدايه باكتري كه قبلا با استفاده از آزمون هاي بيماري زايي، بيوشيميايي والگوي نقوش پروتئيني مورد ارزيابي قرار گرفته بودند ، استفاده شد.پس از طراحي و ساخت پرايمرهاي اختصاصي ژن dnaK تكثير قطعه 730 نوكلئوتيدي در جدايه ها صورت پذيرفت. پس از خالص سازي و توالي يابي قطعات تكثير شده همرديف سازي چندگانه( Multiple sequence alignment) با ساير توالي هاي موجود در بانك داده NCBI، نتايج نشان داد كه جدايه هاي بومي داراي تنوع خوبي در توالي ژن مذكور مي باشند. با اين حال توالي هاي بدست آمده از جدايه هاي مذكور بيش از 98 درصد با توالي هاي ژن dnaK در گونه Xanthomonas arboricola شباهت داشتند. اين نتايج بيانگر اين است كه عامل اين بيماري در توسكاي ييلاقي در كشور متعلق به جنس و گونه Xanthomonas arboricola مي باشد.