بررسي بيوانفورماتيكي عملكرد ژن FT در گياه توت فرنگي

مهم ترين تغيير نموي در چرخه زندگي گياهان شروع گلدهي مي باشد. ژن Flowering Locus T يا FT(JN172098.1 accession number) يك پروتئين اتصال فسفاتيديل اتانول آمين مي باشد، كه در شرايط طول روز بلند تحت تاثير ژن CO در برگ ها فعال شده و پس از انتقال به مريستم انتهايي نقش كليدي در توليد جوانه گل بازي مي كند. انتقال اين ژن به گياهان باعث تسريع گلدهي شده است، بنابراين بررسي پروموتر اين ژن با مقايسه Cis-element هاي موجود، جهت بالا بردن آگاهي و نحوه عملكرد آن حائز اهميت مي باشد. با بدست آوردن CDS ژن FT از NCBI حدود 1500 جفت باز از ناحيه پروموتري اين ژن از سايت Phytozome گرفته شده و سپس آناليز پروموتر با استفاده از دوسايت Plant CARE و PLACE انجام شد. نتايج نشان داد كه حدود 14 مورد Cis-element پاسخ دهنده به نور و ريتم سيركادين در اين پروموتر مشاهده شد كه بيانگر اين است كه به طور عمده عامل هاي رونويسي درگير در مكانيسم هاي نوري به اين نواحي Cis-element متصل مي شوند. استفاده از اين گونه پروموترها جهت استفاده در كاست هاي ژني در بالا دست ژن هاي موثر در گلدهي، نه تنها در تسريع گلدهي بلكه در مطالعات فيزيولوژيك نيز حائز اهميت مي باشد.