شناسايي نقش عملكردي ژن‌هاي هدف BTA-MIR21-3P در فرآيند توليد شير در گاو شيري

Identification of functional role of Beta-miR21-3P target genes in dairy milk production process

ميكروRNAها، RNAهاي غير كدكننده‌اي هستند كه بيان ژن‌ها را پس از رونويسي از طريق تجزيه mRNA يا مهار ترجمه آن‌ها، كنترل مي‌كنند. مطالعات گذشته نشان داده‌اند كه كنترل فرايند فيزيولوژيكي توليد شير تحت تأثير مولكول‌ محافظت شده bta-miR-21-3p قرار مي‌گيرد. امروزه اهميت توليد شير و فراورده‌هاي آن در سبد غذايي بر كسي پوشيده نيست. شير سرشار از ويتامين‌هاي محلول در آب هست كه تقريباً تمام ويتامين‌هاي مورد نياز بدن را تأمين مي‌كند. از اينرو، هدف پژوهش حاضر بررسي نقش عملكردي ژن‌هاي هدف bta-miR-21-3p در فرايند توليد شير است. در اين مطالعه شناسايي ژن‌هاي هدف bta-miR-21-3p توسط نرم‌افزار miRWalk انجام و ژن‌هايي انتخاب شد كهbinding P value=1 باشد. از پايگاه داده‌اي DAVID براي شناسايي مسيرهاي ژني و عملكرد ژن‌هاي هدف استفاده شد. در مرحله آخر به منظور دستيابي به شبكه ژني و مجسم‌سازي شبكه، نرم‌افزار Cytoscape مورد استفاده قرار گرفت. تعداد 1200 ژن هدف براي bta-miR-21-3p شناسايي شد كه از بين آن‌ها ژن‌هاي PTPN11، MAPK8، WNT9B ،TRAF7 ،CTNND1 ،STAT5A ،TAB1 ، CDH3 بر اساس آناليز عملكردي ژن‌ها و پارامترهاي آماري شبكه بيشترين تأثير را بر روي توليد شير داشتند. بر اساس نتايج اين مطالعه مشخص شد ژن-هاي هدف مولكول محافظت شده bta-miR21-3p در بيوسنتز تركيبات شير و فعاليت طبيعي غده پستاني گاو نقش مهمي دارند.

Micro-RNAs are non-coding RNAs that control the expression of genes after transcription by mRNA decomposition or translation inhibiting. Previous studies have shown that the control of the physiological process of milk production is affected by the protected bta-miR21-3P molecule. Today the importance of producing milk and its products in a basket of food is not covered by anyone. Milk is rich in water-soluble vitamins needed by the body. Therefore, the present research objective is to investigate the functional role of bta-miR-21-3p target genes in the milk production process. In this study, bta-miR-21-3p target genes were identified by miRWalk software and genes that had binding P value=1 were selected. The DAVID database was used to identify genetic pathways and target genes function. In the last step, Cytoscape software was used to access the gene network and network visualization. A total of 1200 target genes were identified for bta-miR-21-3P, and among them, PTPN11, MAPK8, WNT9B, TRAF7, CTNND1, STAT5A, TAB1 and CDH3 genes have the most effect on milk production based on functional analysis of genes and network statistical parameters. The results of this study show that the target genes of bta-miR21-3P conserved molecule have a significant role in the biosynthesis of milk compounds and normal activity of the glandular mammary gland.