شناسايي، بررسي و مقايسه Insilco پپتيدهاي زيست فعال بازدارنده ورود SARS-CoV-2 به سلول، مشتق از 5 پروتئين متداول غذايي و ريزجلبك Dunaliella salina

يكي از راه‌هاي ورود ويروس كرونا به سلول از طريق اتصال دومين اتصال به گيرنده (RBD) پروتئين اسپايك ويروس با گيرنده آنزيم مبدل آنژيوتانسين‌2 (ACE2)سلول انسان است. بنابراين مهاركننده‌هاي RBD و ACE به سبب ممانعت از ايجاد برهمكنش ويروس با سلول، اهداف كليدي براي توسعه دارو عليه COVID-19 هستند. جستجوي مواد طبيعي قابل خوردن با ويژگي مهار RBD و ACE، مي‌تواند راه حل بسيار مفيد و ساده‌اي براي پيشگيري و مقابله با همه‌گيري ويروس كرونا باشد. در پژوهش حاضر فعاليت زيستي تعدادي از پروتئين‌هاي معمول سبد غذايي و زير واحد بزرگ پروتئين روبيسكو Dunaliella salina توسط ابزارهاي بيوانفورماتيكيBIOPEP، Pepcalc، Toxinpred، PepSMIو Swiss ADME مقايسه شد. يافته‌ها حاكي از آن است كه فراواني وقوع قطعات پپتيدي زيست فعال در توالي پروتئين با منشاء ريزجلبك، در مقايسه با پروتئين گوشت گاو و مرغ، تخم‌مرغ و سويا بيشتر بود. همچنين توانايي بيشتر آنزيم كيموتريپسين نسبت به ساير آنزيم‌هاي گوارشي در توليد قطعات زيست فعال محرز شد. از مجموع 17 نوع پپتيد حاصل از هضم آنزيم‌هاي گوارشي همه غيرسمي و 10 مورد از آنها با احتمال بالاي جذب توسط سيستم گوارش مشاهده شدند. با توجه به يافته‌هاي اين پژوهش پپتيدهاي زيست فعال حاصل از هضم آنزيم‌هاي گوارشي زير واحد بزرگ روبيسكو ريزجلبك ترجيح بيشتري در مقايسه با ساير پروتئين‌هاي متداول سبد غذايي انسان به‌عنوان منبع غذايي طبيعي و سرشار از پيش‌سازهاي احتمالي مهاركننده ACE براي توليد يك دارو حاوي پپتيدهاي زيست فعال پيشنهاد مي‌دهد.