مقايسه توالي ژن HSPA6 در گونه‌هاي مختلف

Comparison of HSPA6 gene sequence in different species

پروتئين‌هاي شوك حرارتي (HSPها) نقش كليدي را در مقاومت در برابر استرس و هموستازي پروتئين بازي‌ مي‌كنند. بنابراين، يكي از پاسخ‌هاي معمول فيزيولوژيكي بدن در شرايط استرس گرمايي و ساير استرس‌ها، افزايش بيان پروتئين‌هاي شوك گرمايي (HSP) مي‌باشد. هدف از اين مطالعه بررسي پروتئين HSPA6 در گونه‌هاي شتر و انسان به عنوان گونه‌هاي بسيار مقاوم و داراي مقاومت متوسط در برابر استرس و ساير گونه‌ها در كنار آنهاست. در اين مطالعه ژن HSPA6 انسان، شترهاي تك‌كوهانه عربي و تركمن، شترهاي دوكوهانة اهلي و وحشي، گاوهاي تائوروس، اينديكوس و آميخته‌هاي آنها و همچنين ياك وحشي، گوسفند، بز، گورخر، اسب و اسب پرزوالسكي مورد مقايسه قرار گرفتند. براي درك بيشتر فاصله ژنتيكي و تكاملي هر يك از گونه‌ها نسبت به يكديگر، تنوع ژنتيكي موجود در توالي DNA، اگزون‌ها و پروتئين مورد بررسي قرار گرفت. در اين مطالعه گونة انسان عليرغم فاصله از لحاظ توالي ژن و اگزون، از لحاظ توالي پروتئين بين شترهاي كوهان‌دار و اسب‌سانان قرار گرفت. همچنين ساختار سوم اين پروتئين با استفاده از نرم افزار انلاين Swissmolel تعيين گرديد و نشان داده شد كه تفاوت ساختاري اين پروتئين در بين گونه هاي مختلف وجود ندارد. با توجه به نتايج بدست آمده از لحاظ توالي پروتئين وساختار، امكان وجود عامل ديگر فيزيولوژيكي مكمل علاوه بر توالي پروتئين را تقويت مي‌نمايد.

Heat shock proteins (HSPs) play a key role in stress resistance and protein homeostasis. Therefore, one of the usual physiological responses of the body in the conditions of heat stress and other stresses is the increase in the expression of heat shock proteins (HSP’s). The purpose of this study is to investigate the HSPA6 protein in camel and human species as very resistant species and moderate resistant specie and other species. In this study, The HSPA6 gene of humanHSPA6, Arabian and Turkmen camels, domestic and wild two-humped camels, Taurus, Indicus and their hybrids, as well as wild yak, sheep, goat, zebra, horse and Przewalski horse were compared. To better understand the genetic and evolutionary distance of each of the species to each other, the genetic diversity in DNA sequence, exons and protein was studied. In this study, despite the distance in terms of gene and exon sequence, the human species was placed between humpback camels and equines in terms of protein sequence. Also, the three-D structure of this protein was determined using Swissmolel online software and it was shown that there is no structural difference of this protein among different species. According to the results obtained in terms of protein sequence and structure, it strengthens the possibility of the presence of another complementary physiological factor in addition to protein sequence.