طبقه‌بندي گيرنده‌هاي جفت‌شونده با پروتئين جي با استفاده از شبكه عصبي CLSTM

پروتئين ها ماكروملكول‌هايي هستند، كه از پيوند پپتيدي بين آمينو اسيد‌ها تشكيل شده‌اند. اكثر اعمال حياتي ارگان‌هاي زنده توسط پروتئين‌ها انجام مي‌شود، از جمله اين اعمال مي‌توان كاتاليزور اعمال حياتي، انتقال مواد بين سلول‌ها و غيره را نام برد. در سال هاي اخير با پيشرفت روش‌هاي توالي‌يابي پروتئين ها، توالي بسياري از پروتئين‌هاي جديد كه عملكرد آن‌ها مشخص نيست، كشف شده‌اند. گرچه ساختار سوم پروتئين ها جهت كشف عملكرد و خانواده ي هر پروتئين كافي است، اما هميشه اطلاعات ساختاري براي پروتئين‌ها در دسترس نيست. روش هاي آزمايشگاهي جهت به دست آوردن اطلاعات ساختاري پروتئين‌ها براي تعداد بسيار زياد پروتئين‌هاي موجود بسيار هزينه و زمان‌بر است، از اين رو روش هاي مبتني‌بر توالي از جمله روش‌هاي يادگيري ماشين و يادگيري عميق مورد توجه محققان قرار گرفته است. در اين مقاله، با استفاده از شبكه‌هاي عصبي عميق يك روش جديد براي طبقه‌بندي خانواده هاي پروتئيني ارايه شده است. در ابتدا داده‌هاي پروتئين‌ها پيش پردازش شده اند تا براي ورودي شبكه آماده شوند. سپس وابستگي‌هاي محلي داده‌ها با استفاده از دو لايه از شبكه كانولوشن استخراج شده اند، بردار ويژگي به دست آمده در هر لايه از كانولوشن با استفاده از يك لايه پولينگ مختصر‌سازي شده است و در نهايت براي يادگيري عميق‌تر داده‌ها از يك شبكه عصبي ريكارنت بهره گرفته شده است. نتايج نهايي بيانگر بهبود اين روش نسبت به روش هاي رقيب در اين حيطه مي باشند.