شماره ركورد كنفرانس
5197
عنوان مقاله
تغييرات ترانسكريپتوم در ريشه ذخيره‌اي هويج (daucus L. Carota) در هنگام تجمع كاروتنوئيد
پديدآورندگان
زينتي زهرا Zahra.zinati@gmail.com استاديار بخش اگرواكولوژي، دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي داراب، دانشگاه شيراز , فرخزاده سارا Sfarokhzadeh87@gmail.com دكتري اصلاح نباتات، بخش توليدات گياهي، دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي داراب، دانشگاه شيراز
تعداد صفحه
4
كليدواژه
آناليز مسير KEGG , ريزآرايه , متابوليت ثانويه
سال انتشار
1400
عنوان كنفرانس
هفتمين كنفرانس ملي فيزيولوژي گياهي ايران
زبان مدرك
فارسي
چكيده فارسي
كاروتنوئيدها از اجزاي بسيار مهم تغذيه‌اي رژيم غذايي جانوران هستند و به‌عنوان پيش ماده ويتامين A عمل مي‌كنند. با اين‌كه بسياري از ژن‌هاي بيوسنتز كاروتنوئيد شناسايي شده‌اند، برخي از جنبه‌هاي تشكيل كاروتنوئيد هنوز ناشناخته باقي مانده است. چالش‌هايي كه در افزايش غلظت كاروتنوئيد وجود دارد به‌دليل دانش محدود ما در مورد مسيرهاي علامت‌دهي كنترل كننده بيوسنتز كاروتنوئيد و كراس تاك مسيرهاي متابوليكي مي‌باشد. رويكردهاي ريزآرايه مي‌توانند بينش عميق‌تري را در رابطه با مكانيسم‌هاي تنظيمي كنترل كننده تجمع كاروتنوئيد در كروموپلاست فراهم كنند. در اين راستا داده‌هاي ترانسكريپتوم مربوط به ريشه نارنجي و ريشه سفيد هويج، با هدف شناسايي مسيرها و ژن‌هاي مرتبط با تجمع كاروتنوئيد، توسط نرم‌افزارهاي بيوانفورماتيكي از جمله Expression Console، بسته Bioconductor Limma و پايگاه داده STRING (https://string-db.org/) مورد بررسي قرار گرفت. بر اساس نتايج حاصل ار آناليز ترانسكريپتوم، 903 ژن تفاوت بيان معني‌داري در ريشه نارنجي در مقايسه با ريشه سفيد نشان دادند كه از اين تعداد ژن، 477 ژن كاهش بيان و 456 ژن افزايش بيان نشان دادند. تجزيه و تحليل مسيرهاي غني شده KEGG بيانگر اين بود كه فعاليت مسيرهاي فتوسنتز – پروتئين‌هاي آنتن (mtr00196)، مسيرهاي متابوليكي (mtr01100)، مسيرهاي نظارتي mRNA (mtr03015)، متابوليسم گليسروليپيد (mtr00561) و بيوسنتز متابوليت‌هاي ثانويه (mtr01110) در هنگام تجمع كاروتنوئيد افزايش يافته است. ژن‌هاي درگير در اين مسيرها مي‌توانند كانديدهاي مناسبي جهت ايجاد گياهان زراعي ترايخته با محتواي كاروتنوئيد مطلوب باشند.
كشور
ايران
لينک به اين مدرک