بررسي اثرات مهاري تركيبات گياهي كانديد بر روي گيرنده‌هاي كروم سنسينگ LasR و RhlR در سودوموناس آئروجينوزا

Inhibitory effects of selected plant compounds on quorum sensing receptors LasR and RhlR in Pseudomonas aeruginosa

سودوموناس آئروجينوزا، يك باكتري گرم منفي فرصت طلب است كه از عوامل اصلي عفونت‌هاي بيمارستاني به شمار مي‌رود. يكي از ويژگي‌هاي بارز سودوموناس آئروجينوزا، توانايي تشكيل بيوفيلم است كه نقش مهمي در محافظت از باكتري در برابر شرايط نامساعد محيطي ايفا مي‌كند. سيستم كروم سنسينگ اين باكتري نقش كليدي در تشكيل بيوفيلم دارد و گيرنده‌هاي LasR و RhlR اجزاي اصلي اين سيستم هستند.اين مطالعه به بررسي اثر تركيبات گياهي منتخب بر روي گيرنده‌هاي LasR و RhlR در محيط سيليكو مي‌پردازد تا تركيبات موثري در مهار اين سيستم شناسايي و معرفي شود.ساختارهاي دو گيرنده كروم سنسينگ از پايگاه PDB با فرمت PDB دريافت شد. تركيبات گياهي فنل‌دار منتخب نيز از پايگاه داده PUB CHEM با فرمت SDF دريافت شد. با استفاده از نرم‌افزارهاي MOLEGRO VIRTUAL DOCKER 6 و MOLEGRO MOLECULAR 2.5، برهم‌كنش ميان تركيبات گياهي منتخب و دو گيرنده بررسي شد.نتايج نشان داد كه تركيبات گياهي Naringin و Hesperidin با انرژي‌هاي اتصال به ترتيب 174.96- و 167.76- با گيرنده RhlR و انرژي‌هاي اتصال 219.44- و 202.53- با گيرنده LasR داراي برهم‌كنش مي‌باشند. اين تركيبات گياهي به عنوان مهاركننده‌هاي موثر گيرنده‌هاي LasR و RhlR عمل مي‌كنند و مي‌توانند راهكارهاي جديدي براي كنترل بيماري‌زايي سودوموناس آئروجينوزا ارائه دهند.مطالعه نشان داد كه تركيبات گياهي مانند Naringin و Hesperidin پتانسيل بالايي براي مهار سيستم كروم سنسينگ سودوموناس آئروجينوزا دارند. استفاده از اين تركيبات مي‌تواند به عنوان راهكاري مكمل در درمان عفونت‌هاي باكتريايي مقاوم به آنتي‌بيوتيك‌ها مطرح شود. مطالعات بيشتر در محيط‌هاي آزمايشگاهي و درون بدن براي تاييد اثرات اين تركيبات ضروري است.

Pseudomonas aeruginosa is a gram-negative opportunistic bacterium that is a major cause of nosocomial infections. One of the notable characteristics of Pseudomonas aeruginosa is its ability to form biofilms, which play a crucial role in protecting the bacteria against adverse environmental conditions. The quorum sensing system of this bacterium is key to biofilm formation, with the LasR and RhlR receptors being the main components of this system. This study aims to investigate the effects of selected plant compounds on the LasR and RhlR receptors in silico to identify and introduce effective compounds for inhibiting this system. The structures of the two quorum-sensing receptors were obtained from the PDB database in PDB format. Selected phenolic plant compounds were retrieved from the PUB CHEM database in SDF format. The interactions between the selected plant compounds and the two receptors were analyzed using the software MOLEGRO VIRTUAL DOCKER 6 and MOLEGRO MOLECULAR 2.5. The results showed that the plant compounds Naringin and Hesperidin interacted with the RhlR receptor with binding energies of -174.96 and -167.76 respectively, and with the LasR receptor with binding energies of -219.44 and -202.53 respectively. These plant compounds act as effective inhibitors of the LasR and RhlR receptors and can offer new strategies for controlling the pathogenicity of P. aeruginosa. The study demonstrated that plant compounds such as Naringin and Hesperidin have a high potential for inhibiting the quorum-sensing system of P. aeruginosa. The use of these compounds could serve as a complementary strategy in the treatment of antibiotic-resistant bacterial infections. Further laboratory and in vivo studies are necessary to confirm the effects of these compounds.