بررسي حضور باكتري فوزوباكتريوم نوكلئاتوم در بيوپسي نمونه هاي باليني بافت سرطان كولوركتال و بافت سالم مجاور

Investigating the presence of Fusobacterium nucleatum in the biopsy of clinical samples of colorectal cancer tissue and adjacent healthy tissue

بيماري سرطان كولوركتال يك بدخيمي رايج در سطح جهان و مانعي مهم در افزايش اميد به زندگي مي باشد. در روند شكل گيري و پيشروي اين عارضه علاوه بر جهش هاي سوماتيك خاص در ژن هاي مختلف، عوامل مهم ديگري اعم از تغييرات ميكروبيوم دستگاه گوارش نيز مي توانند اثرگذار باشد كه در اين ميان مي توان به اهميت باكتري فوزوباكتريوم نوكلئاتوم اشاره كرد. در اين مطالعه ابتدا تعدادي نمونه بافت مبتلا به سرطان كولوركتال به همراه بافت سالم مجاور آنها تهيه گرديد و محتواي DNA آنها استخراج گرديد. به منظور شناسايي مولكولي باكتري فوزوباكتريوم نوكلئاتوم در نمونه ها، يك جفت پرايمر اليگونوكلئوتيدي پركاربرد بر اساس ساير مطالعات سنتز گرديد. پس از بررسي و بهينه سازي شرايط اتصال پرايمرها به ناحيه هدف، با استفاده از روش PCR، چرخه هاي دمايي اعمال و محصول تكثير ژن بر روي ژل آگارز رويت گرديد. در دو نوع نمونه بررسي شده تفاوت آشكاري از نظر وجود قطعه تكثير شده هدف با طول 112 جفت باز مشاهده نشد. در نتيجه، هم در بافت سرطاني و هم در بافت سالم مجاور حضور باكتري و باند امپليكون تاييد شد و قطعات تكثير شده الگوي نسبتا مشابهي در هر دو نوع نمونه داشتند. اين موضوع مي تواند بيانگر آن باشد كه تفاوتي در حضور اين باكتري در بافت سرطاني و بافت سالم مجاور آن وجود ندارد و پيشنهاد مي شود تا بررسي مشابهي با روش هاي كمي و شامل جامعه افراد سالم و تعداد نمونه بيشتر انجام شده تا از تفاوت حضور اين باكتري اطمينان حاصل گردد.

Colorectal cancer is a common malignancy worldwide and an important obstacle in increasing life expectancy. During the formation and progression of this complication, in addition to specific somatic mutations in various genes, other important factors such as changes in the microbiome of the gastrointestinal tract play a role, among which the importance of Fusobacterium nucleatum can be mentioned. In this study, first, a number of colorectal cancer tissue with their adjacent healthy tissue samples were collected and their DNA content was extracted. To molecularly detect Fusobacterium nucleatum in the samples, a pair of widely used oligonucleotide primers based on other studies were synthesized. After examining and optimizing primer binding conditions to the target area, temperature cycles were applied using the PCR method, and the gene amplification product was observed on the Agarose gel. Between the two types of studied samples, no obvious difference was observed regarding the target amplified fragment with a length of 112 bp. Therefore, the presence of the bacterium and the amplicon band was confirmed both in the cancerous and the adjacent healthy tissue, and the amplified fragments had a relatively similar pattern in both types of samples. This can indicate that there is no difference in the presence of this bacterium in the cancerous and the healthy tissue adjacent to it, and it is suggested that a similar study with quantitative methods including the population of healthy people and a larger number of samples is done to determine the difference in the presence of this bacteria.