بررسي اثر ضد سرطاني تركيب پيرازول- 4 -كربوكساميد و مشتقات آن توسط مطالعات داكينگ مولكولي

Investigating the anticancer effect of pyrazole-4-carboxamide compound and its derivatives by molecular docking studies

در اين پژوهش به كمك مطالعات داكينگ مولكولي به بررسي و مطالعه اثر ضد سرطاني مشتقات پيرازول -4 -كربوكساميد بر روي پروتئين VEGFR-2 ( PDBID : 1ywn ) پرداخته شده است. بررسي اهداف مولكولي جديد با قابليت دارويي شدن ، شناسايي و توسعه تعديل‌كننده‌هاي آنها به عنوان داروهاي جديد براي درمان سرطان قابل توجه است. مطالعات داكينگ اين امكان را فراهم مي كند كه فرآيند بررسي مولكولي كوتاه تر شده و از ميان انبوهي از مولكول‌ها مي‌توان به تعداد محدودي از تركيبات با قابليت دارويي شدن رسيد . سپس با توجه به نتايج حاصل شده مي‌توان مولكول‌هايي با بهترين نتيجه و قدرت اتصال با پروتئين به عنوان نمونه‌هاي پيشنهادي جهت بررسي‌هاي آزمايشگاهي و مطالعات در محيط زيستي انتخاب شوند. يكي از دلايل مهم در رگ‌زايي و رشد تومور ، پروتئين‌هاي VEGFR-2 مي‌باشد. نقش مهم اين پروتئين در سرطان باعث شده كه مهار آن به يك ماهيت تحقيقاتي مهم در درمان سرطان تبديل شود. امروزه شبيه‌سازي‌هاي رايانه‌اي از بهترين روش‌ها براي مطالعه اين برهمكنش‌ها هستند .در بخش اول اين پژوهش براساس مطالعات صورت گرفته از ميان مشتقات پيرازول كه به عنوان قوي‌ترين مهاركننده‌هاي پروتئين VEGFR-2 شناخته شده‌اند تركيبي با ثابت مهاركنندگي مطلوب و قدرت مهاركنندگي بالا انتخاب و از آن به عنوان مرجع استفاده شد. در قسمت دوم پژوهش 25 تركيب از مشتقات پيرازول -4 -كربوكساميد با استفاده از داكينگ مولكولي مورد مطالعه و بررسي قرار گرفتند كه از ميان آن‌ها يك تركيب با انرژي اتصال منفي‌تر به عنوان ليگاند پيشنهادي براي مهار مولكول هدف 1YWN از خانواده پروتئين‌هاي VEGFR-2 به عنوان قوي‌ترين مهاركننده انتخاب شده است.

This research employs molecular docking studies to investigate the anti-cancer effects of pyrazole-4-carboxamide derivatives on the VEGFR-2 protein (PDBID: 1ywn). Significantly, the exploration of new molecular targets with pharmaceutical potential and the development of their modulators as novel cancer therapeutics are in progress. Molecular docking studies streamline molecular analysis, enables the refinement of a vast pool of molecules into a limited set of pharmacologically promising compounds. Consequently, based on these findings, molecules exhibiting the strongest binding affinities to the protein are considered as potential candidates for laboratory experiments and environmental investigations. VEGFR-2 proteins play a pivotal role in tumor angiogenesis and growth. Their inhibition is a central focus in cancer treatment research. Today, computer simulations stand as an efficient method for studying these interactions. The initial part of this research identifies a pyrazole derivative, renowned for its potent inhibition of VEGFR-2 proteins, characterized by desirable inhibitory constants and high potency, serving as a reference. In the second part the research delves into the study of 25 pyrazole-4-carboxamide derivatives through molecular docking, culminating in the selection of a ligand with a more negative binding energy as the proposed inhibitor for the target molecule 1YWN within the VEGFR-2 protein family, signifying its exceptional inhibitory potential.