بررسي بيوانفورماتيكي ژن Dehydrin در جو و چند گياه مختلف

Bioinformatic investigation of Dehydrin gene in barley and several different plants

پروتئين دهيدرين دومين گروه از پروتئين هاي آبدوست Late embryogenesis abundant proteins (LEA) است كه مقدار آن با تنش هاي محيطي از جمله خشكي در گياهان افزايش مي يابد. در اين پژوهش به منظور مطالعه و بررسي بيوانفورماتيكي ژن دهيدرين، ابتدا توالي اين ژن در گياه جو و چند گياه ديگر با استفاده از پايگاه داده NCBI بدست آمد. با نرم افزار bioEdit همرديفي توالي ها صورت گرفت. نتايج مطالعات بيانگر اين بود كه طول اين پروتئين در بين گياهان از 133 الي289 اسيد آمينه متغيير است. بررسي روابط فيلوژني نشان داد كه ژن دهيدرين در گياه كاملينا با فاصله زياد از جو و ديگر گياهان قرار گرفته است. بيشترين ضريب خاموشي اين پروتئين متعلق به گياه كاملينا با مقدار 7450 بود كه بيانگر طول عمر بالاي آن است. بررسي جايگاه سلولي نشان داد كه اين پروتئين با فراواني بالا در سيتوپلاسم و هسته وجود دارد. از سويي نتايج حاكي از بالا بودن نسبت آب دوستي دهيدرين نسبت به ميزان آبگريزي اين پروتئين مي باشد كه با انعطاف پذيري اين پروتئين در برابر مقاومت به تنش نقش دارد.