مرکز منطقه ای اطلاع رساني علوم و فناوري - بررسي تنوع ژنتيكي ژن لپتين در گونه هاي مختلف شتر

چكيده فارسي :

يكي از عناصر كليدي تنظيم مصرف خوراك لپتين مي‌باشد كه با تحريك مركز گرسنگي در هيپوتالاموس باعث تنظيم اشتها مي‌گردد. علاوه بر آن ثابت شده است كه اين هورمون بر روي عملكرد توليد شير برخي از گونه‌ها مانند گاو و گوسفند تاثير مي‌گذارد. هدف از اين مطالعه بررسي تنوع ژنتيكي و تفاوت بين گونه‌هاي مختلف شتر است كه نتايج آن مي‌تواند ما را در شناخت بهتر اين ژن و تاثير آن بر روي عملكرد شتر كمك نمايد. توالي ژن لپتين شتر تركمن (Camelus dromedarius) به كمك توالي يابي كل ژنوم و توالي ژن لپتين شتر عربي (Camelus dromedarius)، شتر دوكانه اهلي (Camelus Bactrianus) و وحشي (Camelus Ferus) از بانك ژن (www.ncbi.nlm.gov) تهيه گرديد. در اين مطالعه از ژنوم يك نفر شتر تركمن توالي‌يابي شده توسط دستگاه Hiseq 2000 شركت ايلومينا استفاده شد. داده‌هاي خام حاصل از توالي‌يابي با استفاده از روش Denovo مونتاژ شد و در مجموع 235978 كانتيگ بدست آمد. سپس با استفاده از خوانش منطقه‌اي، كانتيگ مربوط به ژن لپتين استخراج گرديد. سپس با تجزيه و تحليل ژنوم هم‌ترازي بخش‌هاي مختلف توالي درخت فيلوژني تهيه گرديد. در كليه موارد تجزيه و تحليل توالي‌ها با استفاده از نرم افزار CLC Genomics Workbench 12 انجام گرفت. نتايج نشان داد كه طول و توالي ژن لپتين در گونه‌هاي مختلف متفاوت مي‌باشد. همچنين عليرغم تفاوت در توالي اگزون‌هاي ژن لپتين، توالي اسيدهاي آمينة پروتئين گونه‌هاي مختلف شتر هيچ تفاوتي نداشتند. نتايج اين تحقيق با تحقيقات ديگر در گونه‌هاي مختلف مشابهت داشت.