مطالعه برهم كنش سه مشتق از عصاره گياه شيرين بيان با آنزيم بوتيريل كولين استراز موثر در آلزايمر به روش مدل سازي مولكولي

Studying the interaction of three derivatives of licorice plant extract with butyrylcholinesterase enzyme effective in Alzheimer s disease by molecular modeling method.

گياه شيرين بيان همواره به دليل خواص دارويي متعددش در طب سنتي باستان مورد توجه قرار گرفته است. شواهد تجربي نشان داده است تركيبات موجود در عصاره‌ ي شيرين بيان بر بيماري آلزايمر موثر است با اين حال، مكانيسم عمل آنها مشخص نيست. آنزيم بوتيريل كولين استراز نقش موثري در مكانيسم مولكولي آلزايمر دارد. در اين مطالعه، تأثير متقابل 3 مشتق از عصاره گياه شيرين بيان با آنزيم بوتيريل كولين استراز با استفاده از روش داكينگ مولكولي بررسي شد. ساختار ليگاندهاي مورد مطالعه با استفاده از روش تئوري تابعي چگالي B3LYP و مجموعه پايه 6-31G بهينه شدند. با محاسبه نمودار مثلثي دلوني/ورونوي مراكز اتمي، حفره‌ها و منافذ ساختار آنزيم به دست آمدند. بر اساس نتايج به دست آمده، آنزيم بوتيريل كولين استراز داراي 9 كانال و 12 منفذ است. كانالي كه عمق آن 24 Å و حجم آن 990.58 ų است، عميق‌ترين كانال است و خاصيت غيرقطبي دارد. برهمكنش 3 ليگاند بهينه شده با آنزيم به وسيله روش داكينگ سرتاسري انجام شد. انرژي اتصال ليگاندها به آنزيم و دنباله هايي كه در برهم كنش آنها دخيل هستند، به دست آمد. نتايج نشان مي‌دهد كه ليگاند 2-(4-متوكسي فنيل)-7-((3-متيل بوت-2-ان-1-ايل)اكسي)كرومان-4-وان بيشترين افينيته اتصال به آنزيم را دارد. نتايج داكينگ نشان مي‌دهد كه برهمكنش ليگاندها عمدتاً از طريق كانال‌هايي كه با مركز فعال آن آنزيم مرتبط است، انجام مي‌شود و به صورت مستقيم با دنباله هايي‌ كه مركز فعال را تشكيل مي‌دهند، برهم كنش ندارند. ماهيت برهمكنش ليگاند عمدتا هيدروفوب است.