اولين گزارش كاربرد نشانگر مولكولي TRAP و سيستم الكتروفورز ژل عمودي پلي اكريلاميد بهينه و مقرون به صرفه با رنگ آميزي اتيديوم برومايد در بررسي تنوع ژنتيكي ژنوتيپ هاي آفتابگردان

نشانگر مولكولی جدید Target Region Amplification Polymorphism TRAP برای اولین بار در آفتاب گردان در سال 2003 كشف شد در این نشانگر از یك آغازگر ثابت طراحی شده برای توالی بیان شده برچسب دار Expressed Sequence Tag-EST و یك آغازگر تصادفی برای ایجاد نشانگر چند شكل در اطراف توالی های ژن كاندیدای هدف استفاده می شود این نشانگر بین 30-50 قطعه چند شكل ایجاد می كند و به این دلیل جزو نشانگرهای با درجه چند شكلی بالا به شمار می رود با وجود 12 سال از معرفی این نشانگر هنوز گزارشی در مورد استفاده از آن برای ارزیابی تنوع ژنتیكی در آفتابگردان و حتی سایر گیاهان در كشور وجود ندارد از طرف دیگر در بسیاری از آنالیزهای مولكولی نظیر نشانگرهای مولكولی و انگشت نگاری ژنتیكی ژنوتیپ ها تعداد زیاد نمونه های آزمایشی باعث دشواری كار و صرف هزینه ساخت ژل های متعدد و همچنین صرف زمان زیاد برای انجام آزمایش می باشد در این تحقیق برای بررسی تنوع ژنتیكی با استفاده از نشانگر TRAP از روش جدید الكتروفورز ژل پلی اكریلامید با استفاده از رنگ امیزی اتیدییوم بروماید استفاده شده كه نسبت به روش های رنگ آمیزی نقره و نشاندار كردن آغازگر ها با فلورسنت دارای مزیتهای همچون مقرون به صرفه بودن سرعت بالای آنالیز حجم بالای 196 نمونه ای در هر ازمایش و همچنین استفاده مجدد از ژل ها می باشد نتایج نشان داد كه 19 تركیب آغازگری در مجموع 116 باند ایجاد كردند كه 109 تای آنها چند شكل بود محتوای اطلاعات چند شكل این نشانگر بین 0/03 و0/5 و میانگین 0/33 نشان داد كه به عنوان یك نشانگر قدرتمند با چند شكلی بالا می تواند در بررسی تنوع ژنتیكی ژرم پلاسم آفتابگردان مورد استفاده قرار گیرد