ارزيابي ژنتيكي برخي جمعيت‌ هاي گياه دارويي زيره‌ سياه (Carum carvi) با استفاده از نشانگرها RAPD و ISSR

Genetic assessment of some populations of the medicinal plant Caraway (Carum carvi) using RAPD and ISSR markers

در اين تحقيق به منظور، تعيين رابطه خويشاوندي و فاصله ژنتيكي بين جمعيت هاي زيره ي سياه از نشانگرهاي RAPD و ISSR استفاده شد. با استفاده از نشانگر RAPD در مجموع 126 آلل تكثير شد كه آغازگر TIBMBC08 و TIBMBA02 با 7 آلل كمترين تعداد و آغازگر TIBMBC05با 22 آلل بيشترين تعداد داشتند. در نشانگر ISSR در مجموع 79 الل شناسايي كه آغازگر UBC112 با 1 الل كمترين تعداد و آغازگر UBC809 با 15 آلل بيشترين تعداد داشتند. در نشانگر RAPD، بيشترين ميزان شاخص چند شكلي با ميزان 0/94 مربوط به آغازگر TIBMBC05و كمترين ميزان شاخص چندشكلي با ميزان 0/8 مربوط به آغازگر TIBMBA02 و ميزان شاخص تنوع شانن (0/57) و شاخص تنوع ني (0/38) مشاهده گرديد. همچنين در نشانگر ISSR، بيشترين ميزان شاخص چندشكلي با ميزان 0/92 مربوط به آغازگرهاي UBC809 و كمترين ميزان شاخص چندشكلي مربوط به آغازگر UBC112با ميزان صفر و ميزان شاخص تنوع شانن (0/57) و شاخص تنوع ني (0/39) مشاهده گرديد. بر اساس اطلاعات RAPD و ISSR به صورت توام بيشترين ميزان تشابه مربوط به زيره ي سياه كرمان و زيره ي سياه جندق (0/48) و كمترين ميزان تشابه مربوط به ژنوتيپ هاي زيره ي سياه كرمان و زيره ي سياه نيشابور (0/115) با ميانگين 0/315 مي باشد. تجزيه خوشه اي جمعيت هاي زيره ي سياه را بر اساس اطلاعات توام هر دو نشانگر RAPD و ISSR در سه گروه مختلف كه تا حدودي با موقعيت جغرافيايي آنها مطابفت داشت، طبقه بندي و از همديگر تفكيك نمود.

RAPD and ISSR markers were used in the present study to determine genetic relationship and distance between some populations of Carum carvi. Amplification of genomic DNA all population using RAPD analysis yielded 126 fragments, where TIBMBA02 and TIBMBA08 had the minimum number of fragments (7) and TIBMBC05 had the maximum number of fragments, (22). ISSR marker yielded 79 fragments, where UBC112 and UBC809had the minimum (1) and maximum (15) fragments, respectively. The Diversity Index value of RAPD primers ranged from 0.8 (TIBMBA02) to 0.94 (TIBMBC05) and also Shanoon Diversity and Nei diversity were 0.57 and 0.38, respectively. In ISSR primers The Diversity Index value ranged from 0.0 (UBC112) to 0.92 (UBC809) and also Shanoon Diversity and Nei diversity were 0.57 and 0.39 respectively. According to ISSR and RAPD markers in combination, maximum genetic similarity (0.48) was observed between Kerman and Jandagh Carum carvi while the minimum similarity (0.115) was observed between Kerman and Neishabour Carum carvi with average 0.315. Also, cluster analysis segregated all populations into 3 groups according to geographical zone.