بررسي فيلوژني 16 گونه از دوكفه اي ها در سواحل خليج فارس (جزاير هنگام، لارك، قشم و لنگه ) با استفاده از ژن 16srRNA

Molecular Identification and Phylogeny of 16Species of Bivalvia on Shores of the Persian Gulf (Hengam Island,Larak Island, Geshm Island, Lenge Island)

زمينه و هدف: رده دوكفه اي ها از بزرگ ترين رده هاي شاخه نرم­ تنان مي ­باشد. بسياري از گونه هاي نرم تنان خليج فارس شاخص و از نظر تجاري حائز اهميت اند و برخي از نظر تنوع زيستي، چرخه غذايي و مطالعات تكاملي اهميت دارند. مطالعات بسياري براي شناسايي و رده بندي دوكفه اي هاي ايران صورت گرفته است كه منجر به شناسايي آن ها شده است. هدف از مطالعه حاضر بررسي فيلوژنتيكي و مورفولوژيك دوكفه اي ها در خليج فارس مي باشد. روش كار: نمونه برداري در سواحل بندر عباس، قشم، لارك، هنگام و لنگه در خليج­ فارس انجام گرديد و پس از بررسي ويژگي­ هاي مورفولوژيك، سپس استخراج DNA با روش فنل كلروفرم ايزوآميل الكل و روش تكثير 16s rRNA و سپس توالي­ يابي انجام شد. در اين مطالعه توالي­ ها براي اولين بار ازخليج ­فارس گزارش شده است. داده ها با نرم افزارهاي فيلوژني تحليل شد. يافته ها: مقايسه توالي ژن 16s اين گونه ها با گونه هاي مطالعه شده از ساير مناطق كره زمين كه اطلاعات مولكولي آن ها در دسترس بود، نشان داد كه برخي از گونه هاي دوكفه اي در ايران تشابه ژنتيكي قابل توجه اي با ساير گونه هاي مطالعه شده ندارند و در ايران ايزوله شده اند و تعدادي تشابه ژنتيكي بالايي با گونه هاي مطالعه شده دارند و در يك كلاد با بوت استرپ بالا با گونه هاي ساير دنيا قرار مي گيرند. نتيجه گيري: نتايج نشان داد رده بندي صورت گرفته بر اساس تعيين توالي ژن 16s كاملاً مطابق با رده بندي هاي انجام شده بر اساس صفات ريختي است و اين دو تاييد كننده هم ديگر هستند.

Introduction & Objective: Bivalvia are one of the least studied orders in the Persian Gulf. A survey and molecular analysis was conducted to determine bivalvia species diversity in the Persian Gulf. Phylogenetic relationships among all described species of the bivalvia, were examined with nucleotide sequence data from portions of mitochondrial gene 16srRNA We provide 16s barcode sequences of commertial bivalvia of Persian Gulf, Iran. Industrial activities, ecologic consideration, and goals of the bivalvia mollecular Identification campaign make it crucial that species of the south costal be identified. The reconstruction of evolut phylogeny of these species are crucial for revealing stock identity that can be used for the management of fisheries industries in Iran. Mitochondrial DNA sequences were used to reconstruct the phylogeny of the bivalvia species. Material and Methods: For the purpose, DNA was extracted using Isoamyl alcohl phenol chloroform method. The evolutionary relationships among 16 species of the bivalvia were examined using 550 bp of mitochondrial DNA from the 16srRNA gene. Results: Finally the cladograms were compared and the resulted phylogenetic trees confirmed that the Iran′s species origin is Indo west pacific species .some of Iran′s species, which were grouped with the other bivalvia taxa seem to always form a sister clade with Indo-west pacific species with strong bootstrap. Conclusion: The result completely agrees with the previously defined species using morphological characters. However, we still lack any comprehensive and clear understanding of phylogenetic relationship in this group.