ارزيابي ژن MHC - class II درماهي آزاد درياي خزر (Salmo trutta caspius) به روش SSCP

Analysis of MHC-classII? gene of Caspian trout (Salmo trutta caspius)by using single strand conformation polymorphism (SSCP) method

مولكول هاي MHC در مهره داران نقش مهمي در عملكردسيستم ايمني اكتسابي داشته و ارزيابي اثرات انتخاب طبيعي و رانش ژني بر تنوع ژنوم MHC گونه هاي مختلف بسيار حائز اهميت مي باشد. در اين مطالعه تنوع ژنوم MHCگونه بومي و در معرض انقراض ماهي آزاد درياي خزر (Salmo trutta caspius) كه مورد حمايت برنامه هاي بازسازي ذخاير مي باشد، مورد بررسي قرار گرفت. ازاين رو تنوع جايگاه DAA ژن MHC كلاس II در 50 نمونه ماهي آزاد درياي خزر با استفاده از روش SSCP بررسي شد. نتايج تحقيق نشان مي دهد كه اين ژن حداقل واجد 15 الل مي باشد كه الل هاي MHCScCa-DAA*03 و MHCScCa-DAA*10 داراي بيش ترين فراواني مي باشند. هم چنين هتروزايگوسيتي مشاهده شده (HO) ، مورد انتظار (He) و شاخص شانون به ترتيب برابر 0/82،0/80 و 2/037 مي باشد. در جمع بندي بايد بيان كرد، علي رغم تنوع بالاي ژنوم MHC در ماهي آزاد درياي خزر، ولي با توجه به وضعيت حفاظتي در حال انقراض و دستكاري هاي انساني، بسياري از الل هايي كه فراواني پايين دارند در خطر از دست رفتن مي باشند. ازاين رو توجه به حفظ تنوع اين ژنوم طي برنامه هاي بازسازي ذخاير ماهي آزاد درياي خزر حائز اهميت مي باشد.

MHC molecules have many important functions related to adaptive immune system in vertebrates andassessment of effects of natural selection and genetic drift on MHC genes diversity of different species are very important. In this study، the MHC genes diversity of native and endangered Caspian trout (Salmotruttacaspius) fishesthat is supported by restocking programs، were investigated. Hence، DAA locus of MHC class-IIa gene became analysis in 50 samples of Caspian trout fishes by SSCP method. Results indicated this gene has at least 15 alleles that MHCScCa-DAA*03 and MHCScCa-DAA*10 alleles have the most frequency. Also، observed heterozygosity (Ho)، expected heterozygosity (He) and Shannon index equal to 0.80، 0.82 and 2.037، respectively. In conclusion it must be mentioned، althogh MHC genome of Caspian trout has high allelic diversity، but according to endangered conservational state of this species and human impacts، most of low frequency alleles are in risk of allelic lost. Therefore، the conservation of this genome pool during Caspian trout restocking programs is very critical issue.