شناسايي و تعيين توالي 7 ژن RNA ناقل ميتوكندريايي در مرغ بومي خراسان

Identification and Sequencing of Seven Mitochondrial tRNA Genes in Khorasan’s Native Chicken

هدف اين پژوهش بررسي و تعيين توالي نوكلئوتيدي 7 ژن tRNA در ژنوم ميتوكندري مرغ بومي خراسان و شناسايي جهش هاي احتمالي در آن بود. بدين منظور پس از نمونه­ گيري و استخراج DNA از خون، اين بخش از ژنوم با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي تكثير و در پلاسميد pTG19-T در سويه DH5α باكتري اشيريشياكولاي همسانه سازي گرديد. در نهايت پلاسميد نوتركيب از يك كلوني نوتركيب استخراج و پس از خالص سازي توالي يابي شد. نتايج هم رديفي نوكلئوتيدي اين توالي شباهت 100درصد با توالي مشابه در ژنوم نوكلئوتيدي مرغ مرجع (مرغ اهلي با شماره دسترسيx52392.1) را نشان داد. به ­علاوه در اين مطالعه مشخص گرديد كه مرغ بومي خراسان در توالي هاي نوكلئوتيدي اين 7 ژن با ساير نژاد­هاي گونه مرغ اهلي شباهت 99 درصد دارد. درمقايسه توالي قطعه توليد شده با توالي مشابه در مرغ مرجع، هيچ­ گونه جهش نوكلئوتيدي مشاهده نشد. ترتيب ژن­ هاي tRNA موجود در اين قطعه توالي يابي شده، درست مشابه ترتيب اين ژن­ ها در توالي ژنومي ميتوكندري مرغ مرجع و به­ صورت tRNATrp، tRNAAla، tRNAAsn، tRNACys، tRNATyr، ژن COX1، tRNASer، tRNAAsp و ژن COX2 بود.

The aim of current study was to investigate the nucleotide sequence of seven tRNA genes in mitochondrial gene of Khorasan’s native chicken and identification of possible mutations in it. For performing it، this part of the gene was cloned using the specific amplification initiators and cloned in the plasmid pTG19-T vector in DH5α strain of E-Coli after the sampling and extracting the DNA from whole blood. Finally، the recombinant plasmid was extracted from a recombinant colony and the sequence of it was identified after the purification. The results of the nucleotide blast of this peer showed 100 percent similarity to the same nucleotide sequences of the Gallus Gallus domesticus with access number x52392. In addition to that، it was revealed that Khorasan’s native chicken shows a similarity of 99 percent to the other chicken breeds in nucleotide sequences of these seven genes. Also، no nucleotide mutation was observed while sequence comparison of the produced fragments to the similar sequence of Gallus Gallus. The order of tRNA genes in the sequence studied fragment was entirely identical to the mitochondrial genetic sequence of the Gallus Gallus and it was as follows: tRNATrp، tRNAAla، tRNAAsn، tRNACys، tRNATyr، COX1 gene، tRNASer، and tRNAAsp، and COX2 gene.