تنوع ژنتيكي شوكا (Capreolus capreolus) در استان هاي گلستان و مازندران براساس توالي ژن دي لوپ (D-loop) ميتوكندري

The genetic diversity of roe deer (Capreolus capreolus) in Golestan and Mazandaran provinces by sequencing mitochondrial D-loop

شوكا (Capreolus capreolus) كوچك ترين عضو خانواده گوزن ها (Cervidae) در ايران است. اين گوزن در جهان داراي دو گونه اروپايي - آسيايي (C. capreolus) و سيبريايي (C. pygargus) است، كه از نظر ريختي با يكديگر متفاوت هستند. اين گونه در ايران عمدتاً در مناطق جنگلي با پوشش زيرين نسبتاً متراكم، جنگل هاي جوان، جنگل هاي بين دشت و مناطق كوهستاني زيست مي كند. هدف از اجراي اين مطالعه شناخت تنوع ژنتيكي شوكاي ايران در مناطق مورد مطالعه بر اساس ژن D-loop ميتوكندري و كاربرد آن در برنامه ريزي هاي حفاظتي اين گونه مي باشد. تعداد 8 نمونه از شوكاي ايران از نقاط پراكنش گونه در استان مازندران و گلستان جمع آوري شد. پس از استخراج DNA از نمونه ها شامل بافت ماهيچه و سرگين، شاخ تكثير بخشي از ناحيه كنترل DNA ميتوكندري به طول 366 جفت باز به كمك يك جفت پرايمر يونيورسال صورت گرفت. محصولات PCR پس از توالي يابي جهت بررسي و تعيين فاصله ژنتيكي و تنوع هاپلوتيپي با استفاده از نرم افزارهاي MEGA5،DNASP5 و NetWork بررسي شدند. براساس نتايج به دست آمده، تعداد 3 هاپلوتيپ و 3 جايگاه چند شكلي تشخيص داده شد. هاپلوتيپ هاي مشترك بين نمونه هاي استان گلستان و مازندران وجود دارد كه احتمال آن مي رود ارتباط بين جمعيت هاي دو استان و وجود كريدور ارتباطي بين جمعيت هاي آن ها وجود داشته باشد. فاصله ژنتيكي جمعيت دو استان كم بوده و از نظر حفاظتي بايد مورد بررسي دقيقي قرار گيرند تا اين ارتباط قطع نشود.

Roe deer (Capreolus capreolus) is the smallest member of deer family (Cervidae) in Iran. This deer includes two different species in the world: European-Asian roe deer (C. capreolus) and Siberian roe deer (C. pygargus) which are different morphologically. In Iran، this species mainly lives in forest regions with relatively dense cover، young forests، and the forests between plains and mountain regions. The purpose of this study was to recognize the genetic diversity of Iranian roe deer in studied regions by mitochondrial D-loop gene and its application to conservation programs. Eight samples were collected in Mazandaran and Golestan Provinces. After DNA extraction from samples of muscle tissue and feces، horns، a part of control region of mitochondrial DNA in length 366 base pairs using a universal primer was replicated. The genetic distance and haplotype diversity of obtained sequences was investigated using MEGA 5 and DNASP 5 Softwares. Based on the results، three haplotypes and three polymorphisms were recognized. These results illustrate the connection between these populations. The genetic distance of the populations of two Provinces was low and in point of conservation view، the connection between them must be continued.