عنوان مقاله :
شيوع گسترده تيپ A ويروس زردي نكروتيك رگبرگ چغندرقند در ايران
عنوان به زبان ديگر :
Extensive outbreak of the type A of Beet Necrotic Yellow Vein Virus in Iran
پديد آورندگان :
ابراهيم قمي، مريم دانشگاه آزاد اسلامي، واحد علوم و تحقيقات تهران - گروه بيماري شناسي گياهي , محمودي، باقر سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي كرج - موسسه تحقيقات اصلاح و تهيه بذر چغندرقند , رخشنده رو، فرشاد دانشگاه آزاد اسلامي، واحد علوم و تحقيقات تهران - گروه بيماري شناسي گياهي , نادرپور، مسعود سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي كرج - موسسه تحقيقات ثبت و گواهي بذر و نهال , نوروزي، پيمان سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي كرج - موسسه تحقيقات اصلاح و تهيه بذر چغندرقند
كليدواژه :
چغندرقند , Multiplex PCR , تيپ A , RNA5 , BNYVV
چكيده فارسي :
هدف از اين تحقيق، بررسي ژنوتيپهاي مختلف Beet necrotic yellow vein (BNYVV) در ايستگاههاي تحقيقاتي چغندرقند كشور شامل طرق در خراسان رضوي، زرقان در فارس، مياندوآب در آذربايجان غربي و اكباتان در همدان بود. همزمان نمونههايي از مزارع حوزه كارخانههاي قند تربتجام در خراسان رضوي، نهاوند در استان همدان، كمالآباد در استان البرز، نقده در استان آذربايجانغربي و قزوين در استان قزوين و نيز مزارع كشاورزان اراك در استان مركزي مطالعه شد. جمعا 58 نمونه آلوده ريشه چغندرقند از اين ايستگاهها و مزارع فوق مورد بررسي قرار گرفتند. همچنين تعداد 30 نمونه خاك آلوده از مزارع چغندرقند مغان، طرق، زرقان و كمالآباد كرج جمع آوري و جهت تعيين نوع تيپ ويروس عامل بيماري رقم حساس در آنها كشت شد. براي تعيين نوع تيپهاي A و B، ناحيه TGB ژنوم ويروس BNYVV با روش multiplex PCR تكثير شد. به علاوه، با تكثير قسمتي از ژنوم RNA5 ويروس از طريق تكنيك مولكولي RT-PCR و جفت آغازگر اختصاصي، رديابي تيپ P يا J انجام گرديد. بر اين اساس در بين نمونههاي آلوده مورد بررسي با روش multiplex PCR و جفت آغازگرهاي اختصاصي A و B تنها قطعه 324 جفت بازي تكثير گرديد. به اين ترتيب در بين 88 نمونه آلوده مورد بررسي، بدون استثنا تيپ A شناسايي و هيچكدام از تيپهاي B، P و Jرديابي نشدند. جدايههاي BNYVV حاوي RNA5 در هيچيك از نمونه ها يافت نشد.
چكيده لاتين :
The present study aimed to evaluate different Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) genotypes in sugar beet research stations in Iran including Toroq, Zarqan, Miandoab and Ekbatan. Some samples were also collected from sugar factories’ field in Torbat-e Jam, Nahavand, Kamalabad, Naqadeh and Qazvin and also sugar beet fields in Arak. A total of 58 infected sugar beet root samples were collected. In addition, 30 soil samples were collected from sugar beet fields in Moghan, Toroq, Zarqan and Kamalabad, and a susceptible cultivar was planted in them to determine the causal agent type. To detect type A or B of the virus, TGB region of the virus genome was multiplied using multiplex-PCR. Moreover, partial multiplication of RNA5 using RT-PCR and specific primers was performed to detect type P or J. Only 324 bp fragment was multiplied using multiplex-PCR and specific primers designed for type A or B. Therefore, among 88 samples, only type A was detected. No BNYVV isolates containing RNA5 was observed in any of the samples.
