شناسايي سويه‌هاي واكسن گاوميش و پرندگان پاستورلا مولتوسيدا ساخت موسسه رازي بر مبناي نسخه استراليا طبقه‌بندي ژنتيكي به روش آناليز توالي نوكلئوتيدها در لوكوس‌هاي چندگانه

Characterization of bubaline and avian vaccine strains of Pasteurella multocida from Razi institute as displayed by the Australian version of Multi Locus Sequence Typing analysis

سپتي سمي همراه با خونريزي در اساس يك بيماري عفوني دستگاه تنفسي در نشخواركنندگان و پرندگان مي‌باشد كه توسط پاستورلا مولتوسيدا ايجاد و منجر به خسارت‌هاي اقتصادي قابل توجه مي‌گردد. در ميانه سال‌هاي دهه 1930 و در ابتداي دهه 1980 ميلادي سويه‌هاي ايراني گاوميش (Pm Razi0001) و پرندگان (Pm Razi0002) پاستورلا مولتوسيدا از حيوانات بيمار جداسازي و تاكنون از آنها در توليد واكسن پاستورلوز موسسه رازي استفاده شده است. تكنيك ژنوتايپينگ "تعيين توالي در چند ناحيه ژني" Multi Locus Sequence Typing (MLST) analysis يك روش استاندارد در ژنوتايپينگ پاستورلا مولتوسيدا مي‌باشد. اين تحقيق بدنبال شناخت ساختار ژنومي سويه‌هاي واكسن پاستورلوز ساخت موسسه رازي ايران مي‌باشد. ماده ژنتيكي به روش ساده جوشانيدن از كشت ميكروبي سويه‌ها فراهم گرديد. از KMT1-PCR براي احراز هويت سويه‌ها به عنوان پاستورلا مولتوسيدا استفاده شد. نسخه استراليا روش ژنوتايپينگ MLST شامل 7 ژن حياتي of adk, est, pmi, zwf, mdh, gdh and pgi همراه با اصلاحات اندك بر روي سويه‌هاي هدف اجرا گرديد. تيپ ژنتيكي و كلونال كمپلكس مربوطه با مراجعه به بانك اطلاعات مرجع RIRDC-MLST تعيين شد. تيپ‌هاي ST352 و ST129 (به ترتيب متعلق به كلونال كمپلكس‌هاي CC122 و CC129) در مورد سويه‌هاي واكسن گاوميش و پرندگان شناسايي شدند. دانستن اينكه آيا استفاده از اين سويه‌ها به صورت واكسن در دهه‌هاي متوالي گذشته تاثير بنيادين در جمعيت و اپيدميولوژي اين باكتري در ايران داشته است هنوز نياز به انجام مطالعات بيشتر مي‌باشد.

Hemorrhagic septicemia (HS) is principally an infectious disease of respiratory tract caused by Pasteurella multocida in ruminants and birds resulting in huge economic repercussions. In the mid 1930s and early 1980s the Iranian buffalo (Pm Razi0001) and chicken (Pm Razi0002) strains of Pasteurella multocida were collected respectively from diseased animals. These strains have been used ever since for preparation of pasteurellosis vaccine at Razi institute. Multi Locus Sequence Typing (MLST) analysis is a standard method of genotyping for P. multocida. This was conducted to assess genomic structure of the vaccine P. multocida strains at Razi institute. Genomic material was prepared from freshly cultured strains through a simplified boiling protocol. KMT1-PCR was used to authenticate identity of strains as P. multocida. The Australian RIRDC-MLST typing system targeting 7 housekeeping genes of adk, est, pmi, zwf, mdh, gdh and pgi loci with few modifications was performed on strains. The Sequence Type (ST) and the corresponding clonal complex of the strains was determined by consulting the RIRDC-MLST database. Two STs were identified with ST352 (a subgroup of clonal complex CC122) and ST129 (a subgroup of clonal complex CC129) assigned for the buffalo (Pm Razi0001) and fowl (Pm Razi0002) strains, respectively. If using these strains as vaccine for all the past consecutive decades has had major impacts in population and epidemiology of P. multocida in this country, much more work is required.