تشخيص استرپتوكوكوس پنومونيه بر اساس ژن‌هاي cpsb ، cpsd و psaa

Diagnosis of Streptococcus Pneumoniae based on cpsB, cpsD, and psaA Genes

سابقه و هدف: تشخيص سريع عفونت هاي پنوموككي به منظور درمان موفق و پيشگيري از عواقب آن بسيار مهم است. لذا، هدف ز اين مطالعه راه اندازي روش pcr براساس ژن هاي رمزكننده كپسول استرپتوكوكوس پنومونيه بوده است.مواد و روش ها: در اين مطالعه تجربي، براساس سكانس رفرانس ژن هاي cpsb، cpsd، aroe و psaa استرپتوكوكوس پنومونيه پرايمرهاي اختصاصي طراحي گرديد. هر باكتري به طور جداگانه مورد استخراج ژن قرار گرفت. پروتكل pcr طراحي و انجام شد. محصول pcr سكانس و نتايج به صورت توصيفي تحليل گرديد.يافته ها: نتايج نشان داد، پرايمرهاي طراحي شده عليه ژن هاي cpsb، cpsd، aroe و psaa قادر به تكثير قطعات 159، 202، 254 و 286 جفت بازي هستند. مقايسه و همسان سازي قطعات تكثير شده با ژن هاي رفرانس همولوژي 100 درصدي را نشان داد.استنتاج: نتايج حاكي از آن بود كه مي توان با استفاده از ژن هاي ويرولانس سويه هاي استرپتوكوكوس پنومونيه بيماري زا را از سويه هاي غير بيماري زا و نيز سويه هاي ويريدانس تشخيص داد. بنابراين، با استفاده از روش ارايه شده در اين تحقيق احتمالاً بتوان سويه هاي بيماري زاي استرپتوكوكوس پنومونيه را تشخيص داد و گزارش نمود.

Background and purpose: Fast diagnosis of pneumococcal infections is of great importance in achieving successful outcomes. The aim of this study was to use PCR process based on capsular encoding genes of Streptococcus pneumonia. Materials and methods: In this experimental study, specific primers were designed based on the reference sequences of the Streptococcus pneumoniae cpsB, cpsD, aroE, and psaA genes. All bacteria were subjected to DNA extraction separately. Then, the PCR protocol was performed. Sequencing of the PCR products was done and data was analyzed descriptively. Results: The primer pairs against the cpsB, cpsD, aroE, and psaA genes amplified 159, 202, 254, and 286 bp fragments, respectively. The alignments and comparison of amplified sequences showed a high homology (100%) with the reference genes. Conclusion: According to this study, it is possible to diagnose Streptococcus pneumoniae based on virulence genes, and differentiate the pathogenic Streptococcus pneumoniae from nonpathogenic strains and also viridans groups. Therefore, this method is suggested in diagnosis of pathogenic Streptococcus pneumoniae strains.