بازنگري استرين‌هاي Erwinia amylovora عامل بيماري آتشك درختان ميوه دانه‌دار از نظر تنوع ژنتيكي، بيماريزايي و وجود مقاومت به استرپتومايسين

Investigation Erwinia amylovora Strains Causing Fire Blight Disease in Pome Fruit trees in term of Genetics, Pathogenicity and Resistance to Streptomycin

بيماري آتشك با عامل Erwinia amylovora به عنوان مخرب‌ترين بيماري در خانواده رزاسه است كه در بعضي از استان‌ها توليد محصول به و گلابي را غيراقتصادي نموده است. در اين تحقيق تنوع فنوتيپي، ژنتيكي، بيماريزايي استرين‌ها و نيز احتمال ورود استرين هاي مقاوم به استرپتومايسين صورت گرفته است. تعداد 422 جدايه از نمونه‌هايي كه طي فصل بهار، تابستان و زمستان از مناطق مختلف استان‌هاي خراسان، سمنان، قزوين، لرستان، آذربايجان شرقي، آذربايجان غربي و تهران نمونه‌برداري شد حاصل گرديد. ميزبان‌هاي مورد نظر در اين بررسي سيب، گلابي، به، زالزالك و رز بودند. استرين‌هاي جداشده از نظر ويژگي‌هاي فنوتيپي و مقايسه الگوي پروتئيني شباهت‌هاي بسيار بالايي نشان دادند. همچنين طي ساير بررسي‌ها جدايه‌هاي مختلف جغرافيايي و ميزباني از نظر قدرت و شدت بيماريزايي كه در برگ‌هاي گلابي به صورت شاخه بريده ارزيابي گرديد، مشابه بودند. تعيين حساسيت استرين‌ها به آنتي بيوتيك‌هاي استرپتومايسين، اكسي تتراسايكلين و تركيب اكسي كلرور مس بررسي گرديد و هيچگونه مقاومتي به آنتي بيوتيك‌هاي استرپتومايسين، تتراسايكلين و مس در آنها مشاهده نشد. براساس خصوصيات فنوتيپي، دامنه ميزباني و مناطق جغرافيايي تعداد 75 استرين براي بررسي تنوع ژنتيكي انتخاب شدند كه در انگشت نگاري به روش rep-PCR با آغازگرهاي ERIC و BOX تمامي جدايه‌ها با جدايه مرجع ATCC 49946 هموژن و يكسان بودند و الگوي مشابهي در ژل آگارز ايجاد نمودند. لذا با توجه به نتايج حاصل در پروفيل پروتئيني جدايه‌هاي ايراني با جدايه استاندارد كه تفاوتي مشاهده نشد، تغيير ژنتيكي در جدايه‌ها برخلاف آنچيزي كه انتظار مي‌رفت، ديده نشد و در مديريت اين بيماري، تركيبات شيميايي باكتري‌كش موجود كماكان با دغدغه كمتري قابل استفاده مي‌باشند و نيز يكنواختي استرين‌ها كمك خواهد نمود كه از يك رويه يكسان در تهيه ارقام مقاوم، پيش آگاهي بيماري و مديريت تلفيقي استفاده نمود.

Fireblight that accurred with Erwinia amylovora in some provinces in Iran and worldwide has made non-economic production of pear and quinces. In the survey was conducted in 2000, bacterial strains that causative of apple, pear and quince fireblight were identical in term of biochemical and physiological characteristics, pathogenicity and protein pattern. So we decided that examine the genetic diversity of E.amylovora by use of rep-PCR methods and check the effect of environmental condition and bactericides on resistance of this pathogen. For perform of this study, samples were collected in different of place and provinces of Iran and then transferred to laboratory. Isolation and phenotypic characteristics of some isolate were studied. Electrophoresis of cell-soluble proteins and pathogenicity of strains was determined and in the last step, genetic diversity was evaluated using by rep-PCR and final electrophoresis was performed. In this research, variation of phenotypic, genetic, pathogenecity of strains and the probability of entering steptomycin resistant strains in Iran were tested. Pathogenic strains of E. amylovora (422 isolates) were isolated from diseased pear, quince, apple, crateagus trees and rose shrubs from seven major pome fruit growing provinces in Iran during the surveys. The characteristics of the Iranian isolates and a reffernce strain (ATCC 49946) including colony morphology on nutrient sucrose agar, some biochemical characters, copper, streptomycin and oxytetracyclin sensitivity were determined. The soluble protein patterns of the isolates were also determined using SDS-PAGE. All of the stains were the same in phenotypic characteristics and protein profiles and there was not any difference in disease severity of strains. The same band patterns on agarose gel was detected when the isolates were subjected to rep-PCR fingerprinting using both BOX and ERIC primers. None of the strains tested were resistant to streptomycin, oxytetracyclin and copper. The joint findings were described and compared with those of other authors.