شناسايي و تعيين توالي ژن مربوط به آنتي پورتر هيدروژن/سديم از غشاي پلاسماي گياه Kochia scoparia L.

Characterization and sequence of a hydrogen/sodium anti-porter gene in the plasma membrane of the plant Kochia scoparia

يكي از راھكارھاي گياھان براي كاھش مقدار سديم سيتوزولي، دفع سديم به خارج سلول است. اين دفع خارج سلولي، مانع از اثرھاي سمي سديم در فرآيندھاي سلولي سيتوزول مي شود. ناقل ھاي سديم/ھيدروژن غشاي پلاسمايي (SOS1) يكي از بھترين پروتيين ھاي درگير در اين فرآيند ھستند. در اين پژوھش از گياه دولپه و شورزي Kochia scoparia به عنوان منبع براي جداسازي ژن استفاده شد. بر ھمين اساس با استفاده از آغازگرھاي طراحي شده در مناطق حفاظت شده در گياھان ديگر، طول تقريبي 3600 نوكليوتيدي و به تبعيت از آن توالي 1200 اسيدآمينه اي از توالي كدكننده اين ژن شناسايي و تعيين توالي شد. ميزان شباھت اين توالي در سطح نوكليوتيدي با حداكثر 84 درصد ھمولوژي و در سطح اسيدآمينه اي 92 درصد با استفاده از بررسي BLAST تاييد شد. تجزيه و تحليل ھاي بعدي براي تعيين خصوصيات پروتييني و ارتباط آن با پروتيين ھاي ديگر با استفاده از مطالعات بيوانفورماتيك انجام شد و نتايج نشان داد كه منطقه حاوي مارپيچ ھاي آلفاي آبگريز به عنوان قطعه گذرنده از غشاي پلاسمايي است و در مقابل آن دنباله با تعداد كمتر مارپيچ ھاي آلفاي و خاصيت آبدوستي به عنوان قطعه داخل سلولي پروتيين مي باشد. اين نتايج نقش دفع سديم توسط ناقل ھاي غشاي پلاسمايي را براي وجود واكنش مقاومت به شوري در گياه كوشيا تاييد نمود.