پديد آورندگان :
دانشپور، مريم السادات دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران - دانشكده تحقيقاتي غدد درون ريز و متابوليزم - مركز تحقيقات سلولي و مولكولي - پژوهشكده علوم غدد درو نريز و متابوليزم - گروه ژنتيك سلولي و مولكولي , مسجودي، ساجده دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران - دانشكده تحقيقاتي غدد درون ريز و متابوليزم - مركز تحقيقات سلولي و مولكولي - پژوهشكده علوم غدد درون ريز و متابوليزم - گروه ژنتيك سلولي و مولكولي , غفاري، نسيم دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران - دانشكده تحقيقاتي غدد درون ريز و متابوليزم - مركز تحقيقات سلولي و مولكولي - پژوهشكده علوم غدد درو نريز و متابوليزم - گروه ژنتيك سلولي و مولكولي , رئيسي، مرضيه دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران - دانشكده تحقيقاتي غدد درون ريز و متابوليزم - مركز تحقيقات سلولي و مولكولي - پژوهشكده علوم غدد درو نريز و متابوليزم - گروه ژنتيك سلولي و مولكولي , فلاح، محمدصادق مركز تحقيقات ژنتيك انساني كوثر، تهران
كليدواژه :
نسل جديد تعيين توالي , ژنوم , جهش , پلي‌مورفيسم
چكيده فارسي :
مقدمه: امروزه براي كاهش هزينه در روش‌هاي آزمايشگاهي مرتبط با بيماري‌ها و رسيدن به كوتاه‌ترين زمان پاسخ‌دهي، روش‌هاي جديدي ابداع شده‌اند كه در زماني كوتاه، قسمت بزرگي از ژنوم را تعيين توالي مي‌كنند. اين روش‌ها به نسل جديد تعيين توالي معروف شده‌اند. از اين روش مي‌توان در تشخيص بيماري‌ها استفاده كرد. هدف مطالعه حاضر بررسي عملكرد نسل جديد تعيين توالي با روش ايلومينا بود.
نتيجه گيري: با تكنولوژي پيشرفته توالي‌يابي كل ژنوم، تعيين تغييرات ساختاري ژن‌ها، بررسي‌هاي جامع تعداد نسخه ژن‌ها، شناسايي پلي‌مورفيسم، جهش‌هاي نقطه‌اي و جهش‌هاي كوچك، بررسي بيان ژن‌ها و كاربرد‌هاي مختلف ديگر ممكن شده است. در روش تعيين توالي ايلومينا ابتدا كل ژنوم به قطعات ژني دورشته‌اي شكسته شده، پس از آن برآمدگي‌هاي ناشي از قطعه‌قطعه‌شدن به انتهاي صاف تبديل مي‌شوند و اتصال آداپتور‌ها به هر دو انتهاي قطعات صورت مي‌گيرد و قطعات نمونه ژني به‌وسيله همين آداپتور‌ها به سطح فلوسل با كمك دورگهسازي متصل مي‌شوند، سپس با تكثير نمونه به‌روش تشكيل پل، مجموعه‌اي از كلوني‌هاي حاصل از قطعات (خوشه) ايجاد مي‌شوند و سپس در يك واكنش شيميايي، متوقف‌كننده‌هاي رشد از انتهاي΄3 برداشته و چرخه جديد آغاز مي‌شود. اين مرحله تا تعيين توالي كل قطعه ادامه مي‌يابد، سپس با كمك توالي مرجع، توالي كل ژنوم تعيين و در نهايت نتايج با پنل ژن‌هاي مرتبط با بيماري مقايسه و تغييرات مشخص مي‌شوند. با روش‌هاي متفاوتي مي‌توان تغييرات مورد نظر در ناحيه ژني را شناسايي و در مواردي با بررسي تغييرات نادر به ارتباط اين تغييرات و تشخيص برخي بيماري‌ها پي‌برد.
چكيده لاتين :
Introduction Nowadays, new methods have been developed to reduce the cost of diseaserelated
laboratory methods and to achieve the shortest response time, which in a short time,
determine a large portion of the genome. These methods are known as the next generation
sequencing techniques. One of the most common application of such as these methods is
diagnosis of disease. The aim of this study was to investigate the performance of Illumina next
generation sequencing.
Conclusion With the advanced technology of sequencing the whole genome, determining the
structural changes of the genes, comprehensive studies of the number of genes, the identification
of polymorphism, spot mutations and small mutations, the study of the expression of genes,
and other applications are possible. In this method, first, the whole genome is broken into
double strand DNA fragments; then, the bumps of fragmentation are converted to the smooth
end, and adapters are connected to both ends of the components, and the sample pieces of
the gene are connected to the flow cell with the help of hybridization by the same adapters. In
the next step, centralized colonies of fragments (clusters) are formed through amplification of
samples, using the bridge method, which subsequently, could be read. In a chemical reaction,
the growth inhibitors will be taken by the end of 3’ and a new cycle begins. The mentioned step
is continued until the sequence of whole cycle of the fragment is detected. The sequences of the
whole genome are, then, determined with reference sequences, and ultimately the results are
compared with the panel of genes associated with the disease and the changes are determined.
Different methods can identify changes in the gene area and, in some cases, with investigating
the rare changes, the relationship between these changes and the diagnosis of certain diseases
can be known.
