بررسي پلي مورفيسم ژنومي كانديدا آلبيكنس جدا شده از واژينيت به روش RAPD-PCR

Evaluation of Genomic Polymorphism of Candida Albicans, Isolated from the Patients with Vaginitis by RAPD-PCR Method

مقدمه كانديدا آلبيكنس همزيست اختياري انسان بوده كه بيشتر در دستگاه گوارش زندگي مي كند. اين گروه قارچ ها در جائي كه پايداري ميزبان در برابر عفونت به طور موضعي يا سيستمي كاهش يابد بيماريزا مي شود. باكتري ها شايع ترين عامل ايجاد كننده واژينيت ها هستند ولي كانديدا آلبيكنس به عنوان دومين عامل مسبب اين عفونت به شمار مي آيد. گونه كانديدا آلبيكنس مسئول 90-70 درصد عفونت هاي قارچي واژينال است. هدف پژوهش مطالعه پلي مورفيسم ژنومي كانديدا آلبيكنس جداشده از زنان دچار واژينيت با استفاده از روش RAPD-PCR مواد و روش ها اين تحقيق مطالعه اي دوره اي بود كه به روش توصيفي_ تحليلي نمودارسازي و اجرا شد. در اين تحقيق 60 نمونه دربرگيرنده 30 نمونه واژينال از بيمارستان شريعتي تهران و 30 نمونه از بيمارستان زنان كرمان توسط پزشك متخصص زنان و زايمان گرد آوري شد. با استفاده از لوپ استريل از مخمرهاي گونه هاي مختلف بر محيط كشت افتراقي كروم آگار كانديدا كشت داده شد. افتراق زيرگونه ها و مطالعه ي ارتباط گونه هاي ويژه با اشكال باليني و تايپينگ جدايه هاي آلبيكنس به روش RAPD-PCR انجام شد. نتايج افزايش گونه هاي غير آلبيكنس و مقاوم به داروها نه تنها در نقاط مختلف ايران بلكه در جهان نيز به طور محسوسي ديده مي شود. در اين مطالعه برپايه نتايج كشت و آزمايش مستقيم 60 نفر آلوده به ولوواژينيت كانديدايي از دو استان كرمان و تهران بودند كه از نظر ژنتيكي شباهت ها و تفاوت هايي داشتند و در 14 كلاستر قرار گرفتند. در برخي كلاستر ها سويه هاي تكراري وجود داشت كه نشان از شباهت ژنومي سويه ها دارد. نتيجه گيري چندين روش انگشت نگاري ژنومي براي انواع جدايه هاي باليني كانديدا البيكنس وجود دارد كه بكارگيري روش ژل الكتروفورز ميدان ضربه ايPulsed field gel electrophoresis ، روش هاي انگشت نگاري بر اساس ريبوتايپينگ و روش هاي انگشت نگاري بر اساس PCR براي ارزيابي شيوع و مطالعات اپيدميولوژي سودمند است

Introduction: Candida albicans are human selective symbiosis, mainly located in the gastrointestinal tract. This group of fungi is pathogenic where host resistance reduces to local or systemic infection. Bacteria are the most common cause of vaginitis, but candida albicans are the second leading cause of such infections. Candida albicans are responsible for 70-90% of the fungal infections in the vaginal area. objective: To study the genomic polymorphism of Candida albicans isolated from women with vaginitis using RAPDPCR method. Materials and Methods:This cross-sectional study was designed and implemented by descriptive-analytic method. In this research, 60 samples of 30 vaginal samples from Shariati Hospital (Tehran) and 30 samples from Kerman Women's Hospital were collected by gynecologist and obstetrician. Using a sterile loop, various species yeasts were cultured on a differential chromatographed medium of Candida agar. Differentiation of subspecies and study of the possible relationship between specific strains and clinical forms was done. Typing of Albicans isolates was also done using RAPD-PCR method with random primers. Results: Increased non-albicans and resistance to drugs not only in different parts of Iran but also in the world have been reported. In this study, based on the results of culture and direct experiment, 60 people were found to be infected with candida volvaginitis infection in two provinces of Kerman and Tehran, which were genetically similar and different in 14 clusters. Some clusters have repeated strains indicating similarity to genomic strains. Conclusion: There are several methods for genomic fingerprinting of different types of clinical isolates of candida albicans, using Pulsed Field Gel Electrophoresis (Pulsed Field Gel Electrophoresis) technique, fingerprinting methods based on ribotaiping, and fingerprinting methods based on PCR for epidemiological outbreaks are useful.