بررسي ويژگي‌هاي ژنوتيپي و الگويrep-PCR باكتري Xanthomonas arboricola pv. juglandis، عامل بلايت باكتريايي گردو در استان كهگيلويه و بوير احمد

Genotypic characteristics of Xanthomonas arbaricola pv. juglandis, causal agent of walnut bacterial blight, based on Rep-PCR in Kohgiluye and Buyer- ahmad province

بيماري بلايت باكتريايي گردو ناشي از (Xaj) Xanthomonas arboricolapv. juglandis ، يكي از مهمترين بيماري­هاي درخت گردو است كه در حضور رطوبت و دماي مناسب، خسارت زيادي را به گردو وارد مي كند. طي سال­هاي 1390و 1391، تعدادي نمونه ي برگ و ميوه ي گردو، مشكوك به بيماري بلايت باكتريايي از مناطق مختلف استان كهگيلويه و بويراحمد جمع آوري شده و در آزمايشگاه مورد بررسي قرار گرفت. در مجموع 25 جدايه ي گرم منفي با پرگنه‌هاي ريز، نسبتاً برجسته و زرد رنگ، هوازي اجباري، اكسيداز منفي و كاتالاز مثبت جداسازي و بطور اوليه بعنوان Xaj تلقي و آزمون­هاي تكميلي روي آن ها انجام شد. كليه ي جدايه­ها قادر به هيدروليز نشاسته و توليد H2S از سيستئين بوده و روي محيط كشت YDC پرگنه‌هاي زرد رنگ ايجاد نمودند. نتايج بدست آمده از آزمون­هاي بيوشيميايي و فنوتيپي و نيز آزمون اثبات بيماريزايي روي ميوه گردو، وجود باكتري Xaj را در استان كهگيلويه و بويراحمد محرز نمود. اين اولين گزارش از وجود بيماري مذكور در اين استان است. در بررسي خصوصيات ژنوتيپي در واكنش rep-PCR و با استفاده از نرم افزار NTsys-Pc، جدايه­ها در سطح تشابه 73 درصد در دو گروه قرار گرفتند؛ اما گروهبندي خاصي براساس منطقه جغرافيايي ميزبان، در ميان آنها قابل مشاهده نبود. اين نتيجه نشان ميدهد احتمالا جدايه­هاي Xaj در مناطق مختلف استان، داراي منشا يكساني هستند.

Background and objective Walnut bacterial blight, caused by Xanthomonas arboricola pv. juglandis (Xaj) is one of the most important diseases, causing severe damage at the presence of moisture and the optimal temperature for the development of the disease. The aim of this study was walnut bacterial blight detection, in Kohgiluye and Boyer- Ahmad province and evaluation of genetic diversity of Xaj strains using rep-PCR. Materials and methods During 2011-1012, several samples of walnut′s leaf and fruit, showed bacterial blight symptoms, were collected from Kohgiluyeh and Boyer- Ahmad province of Iran. Bacterial isolates were studied with bacteriological standard methods. Moreover, genetic fingerprint of Xaj strains were evaluated and phylogenetic tree of them was drawn. Results Twenty five isolates of Xaj were showed small, relatively prominent with yellow colony. All isolates were oxidative, Gram and oxidase negative but catalase positive. They hydrolyzed starch and able to produce H2S from cystein ​​and formed yellow colonies on YDC medium. Discussion On the basis of biochemical, phenotypical and virulence test, presence of Xaj in Kohgiluyeh and Boyer- Ahmad province, was revealed. This is the first report of walnut bacterial blight disease in Kohgiluyeh and Boyer-Ahmad province. Genotypic characterization of isolates also was assayed with rep-PCR. All isolates were similar at 73% similarity level, but any relationship among clusters and geographic area were not observed.