بررسي رابطه پليمورفيسم در جايگاه اتصال miR-214 در ژن EGFR با سرطان ريه

Association between miR-214-binding site polymorphism in EGFR and lung cancer in Isfahan popultion

سابقه و هدف: سرطان ريه شايع­ترين سرطان عامل مرگ‌ومير در جهان است و سرطان ريه‌ي سلول­غيركوچك (NSCLC) خصوصاً نوع آدنوكارسينوما شايع‌ترين نوع سرطان ريه مي­باشد. بيشترين موارد آدنوكارسينوما به دليل جهش در انكوژن­ KRAS يا جهش و افزايش نسخه­ي EGFR رخ مي­دهد. پلي مورفيسمrs884225 در EGFR 3'UTR در جايگاه اتصال miR-214 و نزديك جايگاه اتصال miR-27 و miR-128 قرار دارد كه با افزايش بيان EGFR مرتبط است. هدف از مطالعه­ي حاضر بررسي ارتباط rs884225 با سرطان ريه در جمعيت اصفهان مي‌باشد. مواد و روش‌ها: مطالعه­ي حاضر به‌صورت شاهد-مورد روي DNAي ژنومي از نمونه­ي خون 111 فرد سالم و 61 فرد بيمار مبتلا به سرطان ريه انجام شد. ژنوتيپ افراد، پس از طراحي پرايمرها با استفاده از تكنيك تتراپرايمرآرمز-PCR تعيين شد. آناليزهاي آماري به­وسيله­ي نرم­افزار Power Marker و پايگاه اينترنتي SISA انجام گرفت. يافته‌ها: فراواني آلل­هاي C/T در rs884225 در جمعيت اصفهاني سالم و مبتلا به سرطان ريه تقريباً مشابه بوده و ارتباط معني­داري بين اين پلي­مورفيسم با سرطان ريه مشاهده نشد (ژنوتيپOR=2.24 ,p>0.05:CC). همچنين نسبت افزاينده­ اين پلي­مورفيسم در انواع سرطان ريه در جمعيت اصفهان نيز تعيين شد كه ارتباط معني­داري مشاهده نشد (ژنوتيپCC در NSCLC :OR=4.6,p>0.05). نتيجه‌گيري: در جمعيت اصفهان ارتباط معني داري بين rs884225 با سرطان ريه وجود ندارد و نمي توان از اين پلي مورفيسم به عنوان يك ريسك فاكتور بيولوژي نام برد؛ گرچه براي نتيجه گيري دقيق تر، بررسي در جوامع آماري بزرگتر پيشنهاد مي گردد.

Background and Aim: Lung cancer is the most common cause of cancer-related deaths wordwide and non-small cell lung cancer (NSCLC), especially adenocarcinoma, is the most common type of lung cancer. Most cases of adenocarcinoma will occur due to KRAS mutations or EGFR mutations and amplifications. The polymorphism rs884225 which is associated with increased EGFR expression is located in the 3'UTR of the EGFR within the miR-214 binding site, and near the miR-27 and miR-128 binding sites. This study aims to investigate the association between rs884225 and lung cancer in Isfahan population. Methods: This case-control study was conducted on genomic DNA from the blood samples of 111 healthy subjects and 61 patients. After finishing the primer design, the genotypes were determined using the Tetra Primer ARMS-PCR technique. The statistical analysis was performed on the Power Marker software, and the SISA website. Results: The frequency of the alleles C / T at rs884225 was almost similar among the Isfahan population with and without lung cancer, and a significant association between this polymorphism and lung cancer wasn't observed (CC: OR=2.24 ,p>0.05).The Odd Ratio (OR) of this polymorphism in different kinds of lung cancer was also determined in the population that were not statistically significant (CC in NSCLC :OR=4.6, p>0.05). Conclusion: There is no significant association between rs884225 and lung cancer among the Isfahan population and it doesn't seem to be a biological risk factor. Further studies are needed to reach more definite results, though.