شناسايي ژن كد كننده باكتريوسين در شش سويه بومي لاكتوباسيلوس پلنتاروم

Determination of bacteriocin encoding gene in six native strains of Lactobacillus plantarum

كيده باكتريوسين‌ها، پپتيد‌ها يا پروتـﺋين‌هاي سنتز شده ريبوزومي هستند كه بر عليه گونه­هاي ژنتيكي نزديك به باكتري توليد كننده خاصيت ‌كشندگي يا مهاركنندگي رشد دارند و سبب افزايش ماندگاري و ايمني محصولات غذايي مي­گردند. در اين تحقيق، مطالعه بر روي سويه­ هاي بومي لاكتوباسيلوس پلنتاروم (DL2، BL1، L28، L27، L25وEL3)، كه قابليت بازدارندگي رشد آن­ها مورد بررسي قرار گرفته بود، صورت گرفت. بعد از تأييد مطالعات قبلي مبني بر قابليت بازدارندگي سويه­ ها توسط تست انتشار از ديسك (Disk diffusion assay) و مشاهده نتايج مورد انتظار، جهت بررسي ژن كد كننده باكتريوسين، واكنش زنجيره­اي پليمراز (PCR) با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي انجام گرفت. مناطق ژني مورد نظر در سويه­هاي BL1، L28، L25 وEL3 تكثير پيدا كردند. استفاده از پرايمرهاي طراحي شده و توالي­يابي نشان مي­دهد سويه EL3 شامل ژن­هاي ساختاري براي باكتريوسين­هاي plnEF، plnJK و plnN مي­باشد، اگرچه سويه­هاي L28 و BL1 لاكتوباسيلوس پلنتاروم تنها داراي ژن­هاي ساختاري براي توليد پلنتاريسين EF هستند. توالي­ها داراي تشابه 99٪ با ژن­هاي ايزوله­ هاي لاكتوباسيلوس پلنتاروم ثبت شده در پايگاه داده NCBI بوده و توالي اين ايزوله­ ها با شماره دسترسي EL3 (KT028600)، L28 (KT028601) و BL1 (KT028602) در Gene Bank ثبت شده اند.

Bacteriocins are ribosomally synthesized proteins/peptides that have bacteriocidal or bacteriostatic trait against genitically closed species. Bacteriocins have role as biopreservative and increase of the safety of food products. Study on native strains of lactobacillus plantarum (DL2 ،BL1 ،L28 ،L27 ، L25 and EL3) that their growth inhibition ability had been analyzed, was performed. after approving inhibition ability of strains by disk diffusion in previous study, to investigate bacteriocin encoding gene, polymerase chain reaction (PCR) was performed by specific primers. The correspondant region was amplified in L25, BL1, EL3 and L28 strains. Using designed primers and sequencing could be shown that EL3 strain contained the structural genes for the bacteriocins plnEF, plnJK and plnN, howover, the Lb. plantarum strain BL1 and L28 contained only the structural genes for plantaricin EF production. sequences showed ٪99 similarity with bacteriocin genes of Lactobacillus plantarum strains recorded in Gene Bank database. The sequences were submitted at NCBI with accession numbers of EL3 (KT028600), L28 (KT028601) and BL1 (KT028602).