ارزيابي تنوع ژنتيكي ژنوتيپ هاي ايراني و غير ايراني جو با استفاده از نشانگرهاي SSR

Assessment of genetic diversity of Iranian and non-Iranian barely genotypes (Hordeum vulgare L.) using SSR markers

بررسي تنوع ژنتيكي بهترين راه براي استفاده از ظرفيت ژنتيكي موجود در گياه جو جهت برنامه هاي به نژادي مي باشد. در اين بررسي تنوع ژنتيكي 63 ژنوتيپ ايراني و غير ايراني جو تشريح شده است. از 30 جفت نشانگر ريزماهواره استفاده شده، 29 جفت چندشكلي مشاهده شد. در مجموع 225 آلل براي مكان هاي ژني مختلف با ميانگين 2/7 براي هر آغازگر شناسايي گرديد. بيشترين تعداد آلل براي جايگاه هاي Bmag0323، Hvm54 و EBmac679 (با 13 آلل) و كم ترين تعداد براي جايگاه HVM0003 (با 2 آلل) بود. ميزان PIC از 89/0 (براي جايگاه EBmac679) تا 21/0 (براي جايگاه GBM1176) و مقدار شاخص شانون از 46/2I= (براي جايگاه Bmag0323) تا 48/0I= (براي جايگاه GBM1176) متغير بود. گروه بندي ژنوتيپ ها با روش Neighbor-net، و تجزيه خوشه اي با استفاده از روش Bayesian انجام گرديد. در اين روش بهترين تعداد زير جمعيت 4 عدد شناسايي شد كه در اكثر زيرجمعيت ها ژنوتيپ هاي با منشاء ايران ديده شدند. نتايج گروه بندي حاصل از روش Neighbor-net با روش مبتني بر مدل مطابقت زيادي نشان داد. نتايج اين تحقيق نشان داد كه نشانگرهاي ريزماهواره تنوع ژنوتيپ هاي مختلف جو را به خوبي نمايش مي دهند. همچنين با توجه به نتايج به دست آمده، ژنوتيپ هاي بومي ايران نيز تنوع بالايي را از خود نشان دادند.

Genetic diversity is the best way to use available genetic potential for breeding programs in barley. In this study, genetic diversity of 63 Iranian and non-Iranian genotypes have been described. 29 out of 30 pairs microsatellite markers were polymorphic. A total of 225 alleles for different gene loci with an average of 2.7 per locus were identified. The highest number of alleles for Bmag0323, Hvm54 and EBmac679 (with 13 alleles) and the lowest number for the HVM0003 (with two alleles), respectively. The PIC amount and Shannon index value were variable ranging from 0.89 (for the EBmac679) to 0.21 (for the GBM1176) and from I=2.46 (for the Bmag0323) to I=0.48 (for the GBM1176), respectively. Genotype clustering was done using Neighbor-net and Cluster analysis was performed using Bayesian methods. The best number of subpopulations was identified 4 that were seen in most sub-populations genotypes originating from Iran. The results of clustering of Neighbor-net method showed good agreement with the modelbased approach. The results showed that microsatellite markers well represented different genotypes of barley diversity. Also according to the results, native genotypes showed more diversity.