بررسي تاثير تعداد سطوح يك صفت آستانه اي بر دقت برآورد ارزش هاي ارثي، روندهاي ژنتيكي، فنوتيپي و همخوني يك جمعيت اصلاحي

Investigation the Effect of a Threshold Trait Levels on the Accuracy of Breeding Value Estimations and Genetic, Phenotypic and in Breeding Trends in a Breeding Flock

به منظور بررسي تاثير تعداد سطوح يك صفت آستانه اي بر درجه دقت برآورد ارزش هاي ارثي، روند تغييرات ژنتيكي و فنوتيپي و ضريب همخوني، يك جمعيت دامي به تعداد 400 راس به روش تصادفي و با استفاده از محيط برنامه نويسي نرم ­افزار R شبيه ­سازي شد. اين جمعيت براي 7 نسل و با اندازه نسل 200 راس دام تكثير شد. نس ل­ها با يكديگر هم ­پوشاني داشته و در هر نسل 20 درصد از بهترين نرها به همراه تمام دام هاي ماده حداكثر تا 5 نسل شانس شركت در برنامه آميزشي را داشتند. يك صفت با ضريب وراثت­ پذيري 0/25، ميانگين 5 و انحراف معيار 2 شبيه­ سازي شد و 4 نوع سناريوي مختلف درباره ركوردگيري از اين صفت طراحي گرديد. در سناريوي اول مقادير صفت به­ صورت اعداد پيوسته ركوردبرداري شد و در سناريوهاي دوم تا چهارم با فرض ركوردبرداري به وسيله­ ي ارزياب و بر اساس ميزان توانايي وي در تشخيص حالات مختلف صفت، صفت مذكور در 3، 5 و 9 سطح دسته بندي شد. ارزش ارثي دامها از طريق مدل دام ساده و تك صفته برآورد و هر سناريو براي10 بار تكرار شد. دقت برآورد ارزش هاي ارثي براي سناريوهاي اول تا چهارم به ترتيب برابر 0/62، 0/49، 0/59 و 0/61 برآورد گرديد . طي 7 نسل روند ژنتيكي صفت مورد نظر براي سناريوهاي اول تا چهارم به ترتيب برابر با 0/212، 0/162، 0/195 و 0/205 و روند فنوتيپي به ­ترتيب 0/185،0/137، 0/163 و 0/179 برآورد شد . ميانگين ضريب همخوني براي سناريوي اول تا چهارم به ­ترتيب 0/0053، 0/0052 ، 0/0052 و 0/0050 برآورد شد . نتايج نشان داد كه با افزايش دقت ركوردبرداري از يك صفت آستان هاي دقت برآورد ارزش ارثي و پيشرفت ژنتيكي در گله اصلاحي افزايش مي­ يابد. لذا به نظر مي­ رسد ابداع روش ­هاي دقيق ­تر براي اندازه ­گيري صفات آستان هاي بتواند موجب بهبود پيشرفت ژنتيكي و افزايش كارايي يك برنامه اصلاح نژاد شود.

To investigate the effects of categorical trait levels on EBVs accuracies, genetic and phenotypic trends and inbreeding coefficient, a breeding stock contained 400 animals was simulated through stochastic method using R programming package. The population was simulated for 7 generations while each generation contained 200 animals. The generations were overlapped and in each ones 20 percent of the best males and all of the females had a chance to participate in the mating program up to 5 generations. A categorical trait with heritability of 0.25, mean of 5 and standard deviation of 2 was simulated, and on the basis of recording approach, 4 scenarios were designed. In the first scenario a threshold trait was measured as continuous records, while for scenarios 2 to 4, regarding to the appraiser ability a threshold trait were recorded in 3, 5 and 9 categories respectively. Breeding values were estimated by a simple, single trait animal model and all scenarios were replicated for 10 times. The accuracy of breeding value estimations for scenarios 1 to 4 were 0.62, 0.49, 0.59 and 0.61 respectively (p<0.01). Through 7 generations, the genetic trends for scenarios 1 to 4 were 0.212, 0.162, 0.195 and 0.205 and the phenotypic trends were 0.185, 0.137, 0.163 and 0.179 respectively (p<0.01) .The mean of inbreeding coefficient for scenarios 1 to 4 were estimated 0.0053, 0.0052, 0.0052 and 0.0050 respectively (p>0.05). Results showed that, the improvement of recording accuracies for threshold traits lead to increasing in the accuracy of breeding value estimations and the genetic gain. So this is concluded that the development of more accurate measurement tools for threshold traits, could improve the genetic gain and breeding program efficiency.